数据集概述
本数据集围绕亚马逊Heliconius蝴蝶复杂翅膀图案的进化起源展开,包含142个个体(涉及17个物种)的基因组序列数据,聚焦与dennis和ray两种红色图案元素相关的非编码序列调控模块,通过系统发育分析揭示其进化历史及重组机制,为研究形态创新的遗传基础提供支持。
文件详解
- 压缩文件
- 文件名称:Fig2B_2C_FigS1A-C_data_and_code.zip、Alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含图表相关数据与代码、序列比对数据的压缩包
- BEAST相关文件
- 文件名称:Dennis_BEAST_TreeAnnotate、Rays_BEAST_TreeAnnotate(无扩展名);Dennis_BEAST.xml、Ray_BEAST.xml(XML格式)
- 文件格式:无扩展名、XML
- 字段映射介绍:dennis和ray图案元素的BEAST进化树注释文件及XML配置文件
- 系统发育树文件
- 文件名称:ML_tree_Ray.nex、ML_tree_Dennis.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:ray和dennis图案元素的最大似然法(ML)进化树数据文件
数据来源
论文“Evolutionary novelty in a butterfly wing pattern through enhancer shuffling”
适用场景
- 进化生物学研究:分析蝴蝶翅膀图案创新的遗传机制,探究顺式调控模块重组对形态进化的作用
- 基因组学分析:研究非编码序列调控元件(如enhancer)在物种适应性辐射中的功能
- 系统发育分析:利用BEAST和ML树文件解析不同蝴蝶物种翅膀图案元素的进化历史
- 生物多样性研究:揭示物种间基因渐渗如何促进形态多样性的产生与维持