数据集概述
本数据集围绕经济物种海扇贝（Placopecten magellanicus）的基因组结构与海洋环境变异的关联展开，包含245个个体的7163个SNP位点数据，以及温度、盐度等海洋环境参数，旨在分析环境因素对其基因频率梯度的驱动作用，为渔业管理和环境变化响应预测提供依据。
文件详解
- 文件名称：VanWyngaardenM_etal_SeascapeGen_SNPMap4b.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含海扇贝个体的SNP位点基因型数据，记录单核苷酸多态性的位置及等位基因信息
- 文件名称：VanWyngaardenM_et_al_SeascapeGen_SampleSiteDistance.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录采样站点的地理距离信息，支持种群遗传结构的空间分析
- 文件名称：VanWyngaardenM_etal_SeascapeGen_Barcode.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含海扇贝样本的条形码信息，用于个体识别与数据关联
- 文件名称：VanWyngaardenM_etal_SeascapeGen_FinalEnvironmentalData.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：涵盖采样种群（Pop）、经纬度（Latitude/Longitude）、四季温度（SurfAvWinTemp等）、盐度（SurfAvWinSal等）、密度（SigmaT）等海洋环境参数
- 文件名称：VanWyngaardenM_etal_SeascapeGen_Code.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于数据分析的R语言代码文件，支持环境与基因组数据的关联分析
数据来源
论文“Oceanographic variation influences spatial genomic structure in the sea scallop, Placopecten magellanicus”
适用场景
- 海洋渔业管理优化：通过环境与基因组关联分析，提升海扇贝资源管理策略的准确性
- 海洋物种环境适应研究：分析温度、盐度等环境因子对海扇贝基因频率梯度的驱动作用
- 气候变化响应预测：基于环境参数与基因组结构的关联，预测海扇贝对未来环境变化的响应
- 种群遗传结构分析：利用SNP数据与地理距离信息，解析海扇贝的种群分化与基因流限制机制
- 海洋生态基因组学研究：探索海洋底栖双壳类物种基因组结构与海洋环境变异的相互关系
