数据集概述
本数据集源于红鲍（Haliotis rufescens）转录组多态性研究，分析加州海岸三个区域（蒙特雷湾、索诺玛、门多西诺角北部）39个个体的基因流与局部适应模式。识别出117万个单核苷酸多态性（SNPs），其中21579个可在所有个体中基因分型，通过F_ST离群值分析筛选出691个高分化SNPs，关联163个基因，涉及生物矿化、能量代谢及环境耐受等功能，为气候变化下种群适应潜力研究提供基础。
文件详解
- README文件
- 文件名称：README_for_supplementary_materials.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明补充材料内容，包括红鲍从头组装转录组（FASTA格式）、变异位点及所有个体高质量基因型（Q>20）信息，".."表示未分配基因型。
- 补充材料压缩包
- 文件名称：supplementary_materials.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含转录组序列数据和变异位点基因型数据，具体内容参考README说明。
数据来源
论文“Transcriptome-wide polymorphisms of red abalone (Haliotis rufescens) reveal patterns of gene flow and local adaptation”
适用场景
- 海洋生物基因流研究：分析红鲍种群间基因交流模式，验证加州至俄勒冈边境无显著种群结构的结论。
- 气候变化适应性评估：通过局部适应相关基因（如热耐受、低氧耐受基因），预测红鲍应对海洋环境变化的潜力。
- 转录组多态性分析：利用SNPs数据开展红鲍转录组水平的遗传多样性研究。
- 功能基因挖掘：基于离群值SNPs关联的基因，探索生物矿化、能量代谢等关键生理过程的分子机制。
