数据集概述
本数据集包含59个极端嗜盐古菌高质量基因组草案及相关分析文件，结合21个已测序菌株基因组，用于研究极端嗜盐古菌应对渗透压变化的适应策略，涉及钾钠离子转运、镁氯积累机制、转录因子家族扩张及进化起源等内容，共7个文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称：README_for_Supplementary_Dataset_6_Abnormal_GC_regions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明异常GC含量区域相关文件的内容，包括基因簇归属、基因标识符、注释簇等信息，涉及24,935个基因。
- 补充数据集文件
- 文件名称：Supplementary_Dataset_5_All_pI_histograms.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含所有等电点（pI）直方图数据。
- 文件名称：Supplementary_Dataset_6_All_GC_plots.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含所有GC含量分布图数据。
- 文件名称：Supplementary_Dataset_6_Abnormal_GC_regions.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含异常GC含量区域相关数据。
- 文件名称：Supplementary_Dataset_7_All_GC_changepoint_plots.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含所有GC含量变化点分布图数据。
- 补充代码文件
- 文件名称：Supplementary_Code_1_MySQL_database_mining.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含MySQL数据库挖掘相关代码。
- 分子标记文件
- 文件名称：GeneraSpecificMolecularMarkers.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含属特异性分子标记数据。
数据来源
论文“Phylogenetically driven sequencing of extremely halophilic archaea reveals strategies for static and dynamic osmo-response”
适用场景
- 极端环境微生物学研究：分析极端嗜盐古菌的渗透压适应机制及基因组特征。
- 基因组进化分析：探究极端嗜盐古菌的进化起源、基因转移及转录因子家族扩张。
- 分子标记开发：利用属特异性分子标记开展分类鉴定及多样性研究。
- 宏基因组学应用：支持极端环境宏基因组数据的比对与分析。
- 基因注释优化：为自动化基因注释工具提供参考数据，提升注释准确性。
