数据集概述
本数据集包含支持“启动子根据转录因子环境呈现不同动态表现”研究的原始数据，以MAT文件存储，涵盖9个启动子的实验数据。数据分为原始数据（_size.mat）和处理后数据（…MSN2.mat、…YFP.mat），记录了单脉冲或多脉冲实验中细胞荧光信号、分子数量、脉冲参数等信息，可用于分析启动子对转录因子动态的解码机制。
文件详解
- 压缩包文件：HansenZechner_RawData.zip，格式为ZIP，包含所有MAT格式的原始数据文件和处理后数据文件
- 原始数据文件（_size.mat）：
- 格式：MAT
- 变量包括：cell_size_pixels（细胞像素面积）、CFP/CFP_molecules/CFP_raw（CFP信号相关数据）、inhibitor_conc（抑制剂浓度）、MSN2_raw/MSN2_RFP（Msn2信号数据）、pulse_parameters（脉冲参数）、time（时间向量）、YFP/YFP_molecules/YFP_raw（YFP信号相关数据）
- 矩阵结构：CFP/CFP_molecules/CFP_raw、YFP/YFP_molecules/YFP_raw为Nx64矩阵（N为细胞数，64为时间点）
- 处理后数据文件：…MSN2.mat、…YFP.mat，格式为MAT，包含经处理的实验数据
数据来源
论文“Promoters adopt distinct dynamic manifestations depending on transcription factor context”相关研究（参考文献：Hansen and O’Shea, 2013; Hansen et al., 2015; Huang et al., 2016等）
适用场景
- 启动子动态响应机制研究：分析不同转录因子环境下启动子的动态表现差异
- 基因表达调控分析：利用YFP/CFP分子数量数据研究基因表达的定量调控规律
- 转录因子激活实验分析：通过脉冲参数和抑制剂浓度数据，探究Msn2激活水平对启动子的影响
- 单细胞信号动态建模：基于细胞荧光信号时间序列数据，构建转录因子动态与启动子响应的数学模型
