数据集概述
本数据集围绕新开发的蜜蜂高密度SNP基因分型阵列(含103270个SNP)展开,该阵列用于蜜蜂基因组选择、育种及进化适应研究。SNP通过对欧洲61只雄蜂全基因组重测序检测,筛选基于候选区域、基因及育种目标(产蜜量、温顺性、瓦螨抗性)等标准,包含阵列验证及使用建议相关数据,共4个文件。
文件详解
- 文件名称:
SNP_Info_HDHB_SNPAssay.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测包含蜜蜂高密度SNP阵列的核心信息,如SNP的染色体位置、候选基因关联、育种目标关联等筛选标准相关数据
- 文件名称:
SNP_Info_HDHB_SNPAssay.xlsx.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为SNP阵列信息的重复或补充文件,内容与
SNP_Info_HDHB_SNPAssay.xlsx相关
- 文件名称:
Genotypes_for_Supp_Table_2.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含补充表2相关的基因型数据,预览可见多个样本标识(如1_498、1_813等)及基因型分类相关字段
- 文件名称:
Supp_Table_2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为研究中的补充表2,包含与SNP阵列验证、样本基因型代表性等相关的结构化数据
数据来源
论文“Tool for genomic selection and breeding to evolutionary adaptation: Development of a 100K single nucleotide polymorphism array for the honey bee”
适用场景
- 蜜蜂基因组选择育种: 利用SNP阵列数据进行产蜜量、温顺性、瓦螨抗性等性状的基因组选择,优化育种方案
- 蜜蜂性状全基因组关联分析: 基于阵列SNP开展蜜蜂卫生行为、觅食等性状的GWAS研究
- 蜜蜂群体基因组学研究: 分析蜜蜂种群结构、遗传多样性及进化适应机制
- 蜜蜂保护策略制定: 利用SNP数据评估蜜蜂种群濒危程度,为保护措施提供基因组学依据
- 蜜蜂基因分型技术验证: 测试不同组织、样本类型对蜂王基因型的代表性,优化非致死基因型检测方法