黑腹果蝇基因组与转录组数据集

黑腹果蝇基因组与转录组数据集 数据来源:互联网公开数据 标签:果蝇,基因组,转录组,生物信息学,基因,mRNA,蛋白质,基因预测,UCSC,FASTA,CSV

数据概述: 本数据集提供了黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的全基因组序列以及相关的转录组和基因预测信息。黑腹果蝇是生物学研究中常用的模式生物,尤其在遗传学和发育生物学领域具有重要地位。数据集来源于UCSC基因组信息学下载页面,使用August 2014版本的黑腹果蝇基因组 (dm6, BDGP Release 6 + ISO1 MT)。

数据集主要包括以下几部分:

基因组序列:以FASTA格式呈现,包含果蝇的全部染色体序列。 元数据信息:包括CpG岛、细胞遗传学带和简单重复序列等基因组注释信息,以CSV格式提供。 mRNA序列:包含来自GenBank和RefSeq的mRNA序列,以FASTA格式提供,揭示了基因的表达情况。 基因预测:提供了多种基因预测系统的结果,包括AUGUSTUS、GENSCAN、Ensembl和RefSeq等,以CSV格式提供,用于识别基因组中的编码区域。

数据用途概述: 该数据集适用于生物信息学研究、基因组学分析、基因表达研究、蛋白质结构预测等多种场景。研究人员可以利用该数据集进行基因组比对、基因注释、基因功能分析、进化分析等。此外,该数据集也适用于生物信息学教学,帮助学生理解基因组数据的分析方法和研究流程。

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数据与资源

附加信息

字段
版本 1.0
数据集大小 149.34 MiB
最后更新 2025年4月27日
创建于 2025年4月27日
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