数据集概述
本数据集包含黑鲉的表型(体重)和基因型数据,基于300位点SNP面板生成,用于全基因组关联分析(GWAS)、基因组预测及PHATE分析,相关研究成果将发表于两篇水产养殖领域的修订中论文。
文件详解
该数据集包含CSV格式数据文件和PNG格式图片文件,具体说明如下:
- 基因型数据文件(CSV格式):
- genotypes_implant1.csv:包含Implant-1批次黑鲉的基因型数据,字段包括Fish ID及多个SNP位点(如Af_SNP0003、Af_SNP0005等)
- genotypes_implant2.csv:包含Implant-2批次黑鲉的基因型数据,字段同上
- genotypes_implant5.csv:包含Implant-5批次黑鲉的基因型数据,字段同上
- 体重数据文件(CSV格式):
- weights_implant1.csv:包含Implant-1批次黑鲉的体重数据
- weights_implant2.csv:包含Implant-2批次黑鲉的体重数据
- weights_implant5.csv:包含Implant-5批次黑鲉的体重数据
- 图片文件(PNG格式):
- genome.png:基因组相关图片
- implant1.png:Implant-1批次相关图片
- implant2.png:Implant-2批次相关图片
- implant5.png:Implant-5批次相关图片
适用场景
- 水产遗传学研究:分析黑鲉脊柱形态与遗传变异的关联
- 水产育种应用:利用基因型数据预测黑鲉生长速率,辅助选育
- 生物信息学分析:基于300位点SNP面板开展全基因组关联分析(GWAS)
- 数据可视化研究:通过PHATE分析探究黑鲉表型与基因型的复杂关系