黑鲉300位点SNP面板基因型数据集

数据集概述

本数据集包含黑鲉的表型(体重)和基因型数据,基于300位点SNP面板生成,用于全基因组关联分析(GWAS)、基因组预测及PHATE分析,相关研究成果将发表于两篇水产养殖领域的修订中论文。

文件详解

该数据集包含CSV格式数据文件和PNG格式图片文件,具体说明如下: - 基因型数据文件(CSV格式): - genotypes_implant1.csv:包含Implant-1批次黑鲉的基因型数据,字段包括Fish ID及多个SNP位点(如Af_SNP0003、Af_SNP0005等) - genotypes_implant2.csv:包含Implant-2批次黑鲉的基因型数据,字段同上 - genotypes_implant5.csv:包含Implant-5批次黑鲉的基因型数据,字段同上 - 体重数据文件(CSV格式): - weights_implant1.csv:包含Implant-1批次黑鲉的体重数据 - weights_implant2.csv:包含Implant-2批次黑鲉的体重数据 - weights_implant5.csv:包含Implant-5批次黑鲉的体重数据 - 图片文件(PNG格式): - genome.png:基因组相关图片 - implant1.png:Implant-1批次相关图片 - implant2.png:Implant-2批次相关图片 - implant5.png:Implant-5批次相关图片

适用场景

  • 水产遗传学研究:分析黑鲉脊柱形态与遗传变异的关联
  • 水产育种应用:利用基因型数据预测黑鲉生长速率,辅助选育
  • 生物信息学分析:基于300位点SNP面板开展全基因组关联分析(GWAS)
  • 数据可视化研究:通过PHATE分析探究黑鲉表型与基因型的复杂关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.93 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。