数据集概述
本数据集包含向日葵转录组图谱数据,研究微卫星在基因表达分化中的潜在作用。通过对美国堪萨斯州和俄克拉荷马州六个种群的向日葵进行转录组测序,分析不同纬度种群间差异表达转录本与微卫星的关联,探索适应性遗传变异机制。
文件详解
- Reference_173.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含向日葵参考序列信息,用于转录组分析的序列比对参考
- Additional transcriptomes.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,包含补充转录组数据
- Gene Expression Data__95 H annuus transcriptomes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含基因表达数据,字段包括Gene(基因)、OK1-1、OK1-4等样本列,记录不同样本的基因表达量
数据来源
论文“Transcriptome profiles of sunflower reveal the potential role of microsatellites in gene expression divergence”
适用场景
- 向日葵基因表达分化研究: 分析不同纬度种群向日葵的差异表达转录本特征
- 微卫星功能研究: 探索微卫星在向日葵基因表达调控中的潜在作用
- 植物适应性遗传机制分析: 研究自然种群适应性遗传变异的产生机制
- 转录组数据参考: 为向日葵转录组相关研究提供参考序列和表达数据支持