数据集概述
本数据集围绕剑尾鱼自然杂交种群的遗传不相容性展开，通过高分辨率基因组扫描检测非连锁区域间的连锁不平衡，探究物种间生殖隔离相关的基因组区域分布与数量。数据支持分析近期分化物种中遗传不相容性对基因流的限制作用，以及自然或性选择对杂交种的影响。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_LD_analysis_scripts.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含LD分析脚本的使用说明，涉及pairwiseLD_flatlist.php、doLDdirdump.sh、fa2div_window.pl等工具的用法、依赖及参数调整指引
- 代码文件
- 文件名称：ABC_simulation_drift.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于遗传漂变的ABC模拟分析，具体功能需结合脚本内容解读
- 压缩文件
- 文件名称：LD_analysis_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含LD分析相关的脚本文件，如doLDbayespolr.R、LDMeasures_func.R等，支持位点间相关性的p值计算等分析
数据来源
论文“High-resolution mapping reveals hundreds of genetic incompatibilities in hybridizing fish species”
适用场景
- 遗传不相容性研究: 分析剑尾鱼杂交种群中导致生殖隔离的基因组区域数量与分布
- 物种分化机制探究: 研究近期分化物种间遗传不相容性对基因流的限制作用
- 杂交选择压力分析: 探讨自然或性选择对杂交种适合度及遗传结构的影响
- 基因组连锁不平衡检测: 利用提供的脚本工具开展非连锁基因组区域间的LD分析
