数据集概述
本数据集基于脊椎动物蛋白质的同源性分组分析,聚焦胎盘哺乳动物(真兽亚纲)进化支系的新基因起源。通过MCL聚类与全基因组 reciprocal BLASTP,识别出357个胎盘哺乳动物干群特有的新同源群,其中87个在进化中被广泛保留,涉及胚胎发育、脑功能、生殖等核心生物学过程。数据集包含1个文件,为蛋白质ID与同源群列表。
文件详解
- 文件名称:Table S1 - List of all protein IDs and Homology Groups.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含脊椎动物蛋白质的ID信息及其对应的同源群(Homology Groups)分类,记录了胎盘哺乳动物干群特有的新同源群及相关蛋白质数据,支持基因进化时间推断与功能分析。
数据来源
论文“Novel and divergent genes in the evolution of placental mammals”
适用场景
- 胎盘哺乳动物进化研究:分析新基因在胎盘哺乳动物干群的起源模式与进化速率。
- 基因功能注释:通过同源群分类探究新基因在胚胎发育、脑功能、生殖系统中的核心作用。
- 基因组进化机制:研究基因重复、分化对胎盘哺乳动物特异性性状的贡献。
- 生物信息学方法验证:评估MCL聚类与reciprocal BLASTP在同源群识别中的应用效果。