数据集概述
本数据集为论文“Lysosomal damage triggers a p38 MAPK-dependent phosphorylation cascade to promote lysophagy via the small heat shock protein HSP27”的配套数据,包含支持论文结论的原始实验数据和结构模型文件。数据涵盖溶酶体损伤后HSP27与p62相互作用的结构预测、相关信号通路实验结果等内容,总计七个文件,用于验证溶酶体质量控制机制中的关键分子作用及信号传导过程。
文件详解
- 实验原始数据文件
- 文件名称:Figures S1-7_primary data.xlsx、Figures 1-7_primary data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含论文中所有图表(正文图表1-7及补充图表S1-7)对应的原始实验数据,支持溶酶体损伤后信号通路激活、蛋白相互作用及自噬调控等实验结论的验证。
- 蛋白结构模型文件
- 文件名称:HSP27p62complex2_7c455_unrelaxed_rank_001至005_alphafold2_multimer_v3_model_X_seed_000.pdb(共5个文件)
- 文件格式:PDB
- 字段映射介绍:通过AlphaFold2预测的HSP27与p62蛋白复合物的三维结构模型文件,包含不同排名和模型版本的结构数据,用于分析两者的结合界面及关键作用位点。
数据来源
论文“Lysosomal damage triggers a p38 MAPK-dependent phosphorylation cascade to promote lysophagy via the small heat shock protein HSP27”
适用场景
- 溶酶体质量控制机制研究:分析溶酶体损伤后p38 MAPK/MK2/HSP27信号通路对自噬过程的调控机制。
- 蛋白相互作用结构分析:利用PDB文件解析HSP27与p62的结合界面及关键氨基酸位点,探究疾病相关突变的影响。
- 自噬信号通路验证:通过原始实验数据复现溶酶体损伤诱导自噬的分子过程,支持相关机制的深入研究。
- 细胞应激反应机制研究:结合数据探讨氧化应激、热应激等细胞应激对自噬调控通路的激活作用。