数据集概述
本数据集围绕底栖硅藻生物监测展开，通过高通量测序（HTS）技术分析不同DNA提取方法对结果的影响。样本采集自法国、瑞典及马约特的溪流与湖泊，采用五种方法提取DNA并进行rbcL基因扩增测序，包含原始测序数据及样本信息关联文件，为评估DNA提取方法的有效性提供支持。
文件详解
- fastq_file_info.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：关联fastq文件编号与样本信息，包含样本来源、使用的DNA提取方法、原始读数数量等核心字段
- 78_PGM_libraries.rar
- 文件格式：RAR
- 内容介绍：压缩包内包含测序平台提供的原始DNA读数fastq文件，每个测序文库对应一个fastq文件，已由测序平台完成分拆处理
适用场景
- 环境生物监测方法优化：分析不同DNA提取方法对硅藻群落多样性检测结果的影响，优化生物监测技术流程
- 硅藻分子生态学研究：利用rbcL基因序列数据探究底栖硅藻群落结构与环境因子的关联
- 高通量测序数据分析方法开发：基于原始fastq数据开展序列质控、物种注释等生物信息学方法的验证与优化
- 跨区域硅藻多样性比较：结合样本地理信息，研究法国、瑞典及马约特地区底栖硅藻群落的区域差异
