数据集概述
本数据集为Lord Howe岛Howea棕榈同域物种分化研究的第三部分数据，包含通过新型方法构建的遗传图谱及相关分析文件。数据结合双酶切RAD测序技术，识别出全基因组中四十六个高度分化区域，部分区域含与盐、耐旱性相关的基因，为物种分化机制研究提供支持。
文件详解
- 存档文件
- 文件名称：map_sequences.zip、process_raw_data_to_map.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含遗传图谱构建相关的序列数据及原始数据处理流程文件
- 数据文件
- 文件名称：Linkage map marker positions.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：连锁图谱标记位置数据，记录遗传图谱中的标记位点信息
- 代码文件
- 文件名称：Outlier_analysis.R
- 文件格式：R
- 内容说明：用于离群值分析的R代码文件，支持基因组分化区域的统计分析
数据来源
论文“Ecological speciation in sympatric palms: 3. genetic map reveals genomic islands underlying species divergence in Howea”
适用场景
- 物种分化基因组机制研究: 分析Howea棕榈同域物种分化的基因组岛特征及相关基因功能
- 遗传图谱构建方法验证: 验证适用于长寿树种的新型遗传图谱构建技术
- 适应性进化研究: 探究盐、耐旱性相关基因在物种分化中的作用
- 基因组分化区域分析: 利用离群值分析代码识别基因组高度分化区域
