数据集概述
本数据集围绕美国东部松树林蛙(Hyla andersonii)的三个离散种群,整合遗传、形态测量和声学信号三类多变量数据,用于评估种群间的基因、行为及形态交换性,为物种界定及保护单元划分提供依据,共包含9个相关文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README_for_R_script_Acoustic_calc_CC0.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:声学计算R脚本的说明文档,提供脚本使用背景、方法及注意事项
- 统计数据文件
- 文件名称:SumStats.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含BeginFile、BeginPath、numCalls(叫声数量)、DeltaTime_mean(时间间隔均值)、Dur90_mean(90%持续时间均值)、Freq5_mean(5%频率均值)等声学信号统计字段
- 分析项目文件
- 文件名称:Acoustic_Dryad.jmp、Morpho_Dryad.jmp
- 文件格式:JMP
- 字段映射介绍:分别存储声学信号分析项目、形态测量分析项目的结构化数据及分析配置
- 遗传数据文件
- 文件名称:Genetic_arlequin_Dryad.arp、Genetic_Genalex_Dryad.xlsx
- 文件格式:ARP、XLSX
- 字段映射介绍:Arlequin格式遗传数据文件、GenAlEx格式遗传数据表格,包含种群遗传标记信息
- 系统发育分析文件
- 文件名称:RAxML_bestTree.MLmtDNA_PBT、RAxML_COIcytB.phy
- 文件格式:MLmtDNA_PBT、PHY
- 字段映射介绍:基于mtDNA的最大似然树结果文件、COI和cytB基因序列比对文件
- 代码文件
- 文件名称:R_script_Acoustic_calc_CC0.r
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于计算声学信号统计量的R脚本代码
数据来源
论文“Geographic variation in the Pine Barrens Treefrog (Hyla andersonii): concordance of genetic, morphometric, and acoustic signal data”
适用场景
- 物种界定研究:整合遗传、形态、声学多维度数据,验证松树林蛙种群的物种分类地位
- 保护生物学分析:评估不同地理种群的进化显著性单元(ESU),为濒危物种保护策略提供依据
- 种群遗传学研究:分析种群间基因交流模式及遗传分化程度
- 行为生态学研究:探究声学信号地理变异与种群适应的关系
- 生物统计学方法应用:验证多变量证据整合评估物种交换性的方法有效性