数据集概述
本数据集围绕冰岛深海等足类Haploniscus bicuspis的物种形成与杂交展开，整合线粒体COI序列、核基因座（ddRAD）、蛋白质组学图谱及形态特征数据，识别出5个遗传谱系，揭示了格陵兰-冰岛-法罗脊南北侧的物种分化、杂交及基因流情况，为深海生物进化研究提供多组学支撑，共包含34个文件。
文件详解
- 元数据与说明文件
- 文件名称：MetaDataxlsx.xlsx、PaulusBrixetal_Readme.txt、specimen_codes_ipyrad_ddRAD.txt
- 文件格式：XLSX、TXT
- 字段映射介绍：包含样本元数据、数据集说明、ddRAD样本编码对应关系等基础信息
- 基因组学数据文件
- 文件名称：I-V.snps.hdf5、I-III.ustr、I-V.ugeno、I-V.gphocs、I-V.vcf、I-V.phy、I-III.phy、I-V.loci、Test20.loci、I-III.vcf、I-V.nex、I-III.nex、I-V.snps、I-III.snps、I-III.usnps、I-V.usnps、I-III.ugeno、I-III.str、I-V.str、I-V.snpsmap、I-III.snpsmap、I-V.ustr、I-V.hdf5、I-III.snps.hdf5、I-III.seqs.hdf5、I-V.alleles、I-III.alleles、I-V.geno、I-III.geno
- 文件格式：HDF5、VCF、PHY、LOC、NEX、SNPS、USNPS、UGENO、STR、GENO等
- 字段映射介绍：涵盖单核苷酸多态性（SNPs）、基因座、基因型、系统发育分析、群体遗传学模型（gphocs）等核基因与线粒体基因数据
- 蛋白质组学数据文件
- 文件名称：Hellinger_Matrix.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含等足类蛋白质组学分析的Hellinger矩阵数据
数据来源
Senckenberg am Meer
适用场景
- 深海生物物种形成研究：分析格陵兰-冰岛-法罗脊对深海等足类遗传分化的地理阻隔作用
- 生物杂交与基因流分析：基于核基因与线粒体基因数据，探究不同遗传谱系间的杂交模式及基因流方向
- 多组学整合进化研究：整合基因组、蛋白质组数据，解析深海生物近期物种形成的分子机制
- 深海生物多样性评估：识别深海等足类的隐存种，完善深海生物多样性数据库
- 生物形态与遗传关联分析：结合形态特征与多组学数据，验证分类学上的亚种定义合理性
