数据集概述
本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本文件、NGS测序文库质控报告及参考基因组文件，为该实验的转录组数据分析提供了完整的计算流程支持。
文件详解
- 分析脚本文件（.sh格式，共3个）：
- 1_mkindices_STAR_Tg_ME49_v65.sh：用于构建STAR比对索引的脚本
- 2_align_STAR_TgME49_v65.sh：用于STAR序列比对的脚本
- 3_featureCounts_Subread_TgME49_v65.sh：用于Subread featureCounts定量基因表达的脚本
- 质控报告文件：
- NGS_RNA_seq_Library_QC.pdf：PDF格式的NGS测序文库质量控制报告
- 参考基因组文件：
- ToxoDB-65_TgondiiME49_Genome.fasta：FASTA格式的弓形虫ME49株基因组序列文件
- ToxoDB-65_TgondiiME49_utr2exons.gtf：GTF格式的基因组注释文件，包含UTR和外显子信息
适用场景
- 弓形虫转录组差异分析：用于复现或调整IF1相关基因修饰株的RNAseq数据分析流程
- 生物信息学方法复用：为其他弓形虫株或寄生虫RNAseq分析提供标准化脚本模板
- 基因组注释应用：基于提供的参考基因组文件开展基因结构或功能相关研究
- 测序数据质控参考：通过文库QC报告验证NGS数据质量及分析可靠性
