数据集概述
本数据集围绕两种野生啮齿动物(黄颈鼠与 bank voles)的脾脏转录组展开,分析不同功能类别的免疫基因在编码序列和表达上的种间差异,涉及模式识别受体、信号转导蛋白、转录因子等四类免疫基因,探讨序列与表达差异的关联性及对免疫功能的影响。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:bv_ynm_FPKM_log2FPKM_zFPKM_8599_descriptives_KEGG_SeqDiverg_313.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含两种啮齿动物免疫基因的FPKM、log2转换FPKM、标准化zFPKM表达量数据,以及基因描述、KEGG注释、编码序列差异等信息,覆盖8599个基因相关的313项描述性指标
- 压缩文件
- 文件名称:alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含免疫基因序列比对相关的压缩文件,具体内容需解压后查看
适用场景
- 免疫基因进化研究:分析不同功能类别免疫基因的编码序列种间分歧规律
- 基因表达差异分析:探究两种啮齿动物免疫基因表达水平的种间差异及功能关联性
- 分子免疫学机制研究:验证模式识别受体(PRR)序列分歧对其表达差异的影响机制
- 物种免疫功能差异解析:基于序列与表达数据解释两种啮齿动物免疫功能差异的分子基础