数据集概述
本数据集围绕须鲸嗅觉受体基因进化评估展开，包含从须鲸及陆生外类群物种中挖掘的嗅觉受体基因序列、系统发育树文件、分析代码及结果可视化文件，共8个文件，支持基因进化相关研究的复现与分析。
文件详解
- 压缩包文件
- 文件名称：Jauhal_et_al_Mol_Ecol_analysis.zip、family_treefiles.zip、treepics.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：分别包含分析代码、家族树文件、系统发育树图片等归档内容
- 基因序列文件
- 文件名称：baleen_whale_ORs.fna.txt、outgroups_ORs.fna.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：FASTA格式的核苷酸序列文件，包含须鲸及外类群物种的嗅觉受体基因序列，每条序列以物种及基因名称（如>blue_OR10A5_1）为标识，后接ATCG碱基序列
- 表格文件
- 文件名称：newick_trees.xlsx、human_gpcrs_for_finding_outgroup_homologs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：包含正交群树的Newick格式数据、用于寻找外类群同源物的人类GPCRs数据等表格信息
- 系统发育树文件
- 文件名称：all_whale_ORs_iqtree.treefile
- 文件格式：TREEFILE
- 内容说明：包含所有须鲸嗅觉受体基因的系统发育树（Newick格式），用于正交群识别
数据来源
论文“Assessment of olfactory receptor gene evolution in baleen whales”
适用场景
- 基因进化分析: 研究须鲸嗅觉受体基因的进化模式、保守性及与外类群的差异
- 生物信息学复现研究: 利用分析代码及原始数据复现须鲸嗅觉受体基因进化评估的主要结果
- 系统发育树构建与可视化: 基于Newick格式树文件及图片，分析须鲸嗅觉受体基因的系统发育关系
- 基因序列比较研究: 对比须鲸与陆生外类群物种的嗅觉受体基因序列特征，探索适应性进化机制
