数据集概述
本数据集为颌脊椎动物骨干系统发育基因组学研究的配套数据,聚焦于通过选择特定问题相关基因减少系统发育分析中的不一致性。包含58个颌脊椎动物类群、4682个基因的系统发育数据集,以及相关分析文件,旨在支持对系统发育分析中基因选择策略有效性的研究。
文件详解
- 归档文件包
- 文件名称:tree_nex.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含系统发育树相关的NEXUS格式文件,用于存储系统发育分析结果的树结构数据
- 文件名称:Supplementary_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含研究中的补充材料,如额外的分析结果、图表或说明文档
- 文件名称:python_script.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含用于数据处理或系统发育分析的Python脚本文件
- 文件名称:data_nex.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含原始或处理后的基因序列数据,以NEXUS格式存储,用于系统发育分析
数据来源
论文“Selecting question-specific genes to reduce incongruence in phylogenomics: a case study of jawed vertebrate backbone phylogeny”
适用场景
- 系统发育基因组学分析: 用于研究颌脊椎动物骨干系统发育关系,验证不同基因选择策略对系统发育结果一致性的影响
- 基因选择策略评估: 分析特定问题相关基因选择方法在解决系统发育树中难处理节点的有效性
- 系统发育不一致性研究: 探究基因组数据中基因间冲突信号对系统发育分析结果的影响机制
- 生物信息学方法开发: 基于数据集中的脚本和数据格式,开发或优化系统发育基因组学分析流程
- 进化生物学研究: 支持颌脊椎动物进化关系的深入研究,为理解脊椎动物演化历史提供数据基础