数据集概述
本数据集为江户明樱蛤的染色体水平基因组组装数据，包含基因组序列、基因家族注释、系统发育树等信息，旨在揭示其血红素生物合成的分子基础，为贝类遗传育种与群体遗传学研究提供基因组资源。
文件详解
该数据集包含多个文件，具体说明如下：
- 文档与说明文件：
- readme.txt：文本格式，提供数据集标题、作者信息等基础说明
- species_ID.txt：文本格式，记录12个物种的ID映射（如Argopecten.purpuratus对应C001）
- 基因组与注释文件：
- genome_20200314.fasta.out.gff.tar.gz：压缩格式，可能包含基因组注释信息
- bei_reduced_genome_20200314.fasta.tbl：表格格式，简化基因组序列相关信息
- geneFamily.tab：表格格式，基因家族注释数据
- RepeatMasker.html：网页格式，重复序列注释结果
- 系统发育分析文件：
- build_tree.nwk：Newick格式，系统发育树文件
- time_tree.nwk：Newick格式，时间校准的系统发育树
- 12species-groups.xls.tar.gz：压缩格式，12个物种分组信息
- Single_Copy_Orthologue_Sequences.tar.gz：压缩格式，单拷贝直系同源基因序列
适用场景
- 贝类基因组学研究：解析江户明樱蛤基因组结构与功能元件
- 分子进化分析：基于单拷贝基因序列构建贝类系统发育关系
- 遗传育种应用：挖掘血红素合成相关基因，指导贝类良种选育
- 群体遗传学研究：利用基因组数据开展种群遗传多样性分析
