基因序列转录起始位点预测数据集GeneSequenceTranscriptionStartSitePrediction-shujun717
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学,生物信息学,序列分析,深度学习,转录起始位点预测,Promoter预测,神经网络,模型训练
数据概述:
该数据集包含用于预测基因序列转录起始位点(TSS)的数据,主要聚焦于启动子区域的序列特征分析。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态的基因序列数据集。
地理范围:数据未明确地理范围,但可推测为通用生物信息学研究范畴。
数据维度:数据集包含基因序列(sequence)、标签(labels)、方向(directions)和预测值(predictions)等关键字段。promoter_sample.csv包含基因序列,promoter_predictions.csv包含序列及其预测信息,promoter_small.csv包含序列、标签和方向。
数据格式:主要为CSV格式,便于数据处理和分析。此外,还包括用于模型训练和推理的Python脚本(.py)以及预训练的神经网络权重文件(.ckpt)。
来源信息:数据来源于生物信息学研究,并经过处理用于深度学习模型的训练和评估。
该数据集适合用于基因组学、生物信息学等领域的研究,以及用于开发和评估TSS预测相关的机器学习模型。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学领域,如基因表达调控、转录起始机制研究、启动子区域分析等。
行业应用:可应用于生物制药、基因测序等行业,用于基因功能预测、药物靶点发现等。
决策支持:支持基因组研究和生物技术领域的决策,例如加速基因编辑技术的应用。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解基因组数据分析和预测模型构建。
此数据集特别适合用于探索基因序列特征与转录起始位点之间的关系,帮助用户开发和优化TSS预测模型,提高预测准确性。