基因与表型关系嵌入数据集GeneandPhenotypeRelationshipEmbeddingDataset-bhmaop
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学, 表型组学, 机器学习, 嵌入向量, 生物医学, 文本分析, 知识图谱, 关联分析
数据概述:
该数据集包含来自生物医学领域的数据,记录了基因和表型之间的关系,并提供了相关的嵌入向量表示。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态数据集,反映了特定时间点的基因和表型信息。
地理范围:数据覆盖范围不明确,但由于涉及基因和表型,可能涵盖全球生物医学研究领域。
数据维度:数据集主要包括基因和表型的嵌入向量,以及对应的描述信息。具体包括:gene_embeddings.csv(基因嵌入向量)、phenotype_embeddings.csv(表型嵌入向量)、opentargets_step2.for_llm.tsv(基因和表型关联信息,tsv格式)以及opentargets_step2.labels(标签文件,用于辅助分析)。
数据格式:数据以CSV和TSV格式提供,方便进行数据分析和处理。其中,phenotype_embeddings.csv包含“Unnamed: 0”、“0”、“gpt_description”(GPT生成的表型描述)和“embedding”(表型嵌入向量)四个字段。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学和生物医学领域的学术研究,如基因功能预测、疾病关联分析、药物靶点发现等。
行业应用:可以为生物技术公司和制药企业提供数据支持,特别是在基因组学数据分析、药物研发、个性化医疗等领域。
决策支持:支持生物医学研究人员和临床医生进行数据驱动的决策,例如辅助疾病诊断、预测治疗效果等。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等相关课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解基因与表型之间的复杂关系。
此数据集特别适合用于探索基因与表型之间的内在联系,构建预测模型,并提升对生物学过程的理解,从而加速药物研发和疾病治疗。