基于OpenBabel的高效构象识别基准工作流数据集

数据集概述

本数据集为构象识别研究的基准工作流数据,包含寡噻吩和Y6分子的构象搜索输入文件、输出文件及能量计算结果,覆盖不同计算方法生成的构象几何文件、能量摘要等内容,用于支持相关研究的复现与分析。

文件详解

该数据集由两个压缩文件组成,内部按分子类型和搜索方法分类,具体说明如下: - 压缩文件: - Conformer_Searches_Files.rar: 主要包含寡噻吩和Y6分子构象搜索相关文件 - Y6.zip: 包含Y6分子构象搜索的补充文件 - 核心目录结构: - Oligothiophenes目录: 按搜索方法(Genetic、Confab)和分子类型(二噻吩、三噻吩等)划分,包含构象几何文件及能量分析结果 - Confab子目录: 存储Confab方法生成的构象.xyz文件,文件名含能量和RMSD截断参数,子文件夹下有ff、SP-DFT、QC-Opt等能量分析结果 - Genetic子目录: 存储Genetic方法生成的构象.xyz文件,按参数变量(Mutability、NumConf等)划分,含UFF力场计算结果 - Y6_Conformer_Search目录: 存储Y6分子构象搜索文件,包含初始结构文件、构象生成文件及能量分析子目录 - 子目录: DFT-SP(单点DFT计算)、QCOpt_energies(优化构象能量)、ff_energies(UFF力场计算)、Second_Searches(后续搜索结果) - 关键文件类型: - .xyz文件: 构象几何结构文件(优化或非优化) - .csv文件: 能量值数据(如ConfEnergieseV.csv) - .txt文件: RMSD计算结果(如RMSD.txt) - .pdf文件: 分析图表(如output_dendro.pdf、output_Energy.pdf)

适用场景

  • 计算化学研究: 用于构象识别方法的性能评估与基准测试
  • 分子模拟分析: 支持寡噻吩和Y6分子构象稳定性与能量分布研究
  • 计算方法优化: 可用于比较不同构象搜索算法(Genetic、Confab)的效率与准确性
  • 材料科学应用: 为有机电子材料(如Y6)的结构-性能关系研究提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 55.58 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。