抗体结构与序列分析数据集AntibodyStructureandSequenceAnalysis-nayan082
数据来源:互联网公开数据
标签:抗体, 蛋白质结构, 序列分析, PDB数据库, 结构生物学, 机器学习, 结构预测, 生物信息学
数据概述:
该数据集包含来自蛋白质数据库(PDB)的数据,记录了抗体的结构和序列信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未标明具体时间,视作静态结构数据集使用。
地理范围:数据来源于PDB数据库,涵盖全球范围内的抗体结构。
数据维度:包括PDB ID、链代码、氨基酸序列(seq)、二级结构信息(sst8和sst3)、抗体序列、序列长度(len)、是否包含非标准氨基酸(has_nonstd_aa)、实验方法(Exptl)、分辨率(resolution)、R-factor、FreeRvalue等字段。
数据格式:CSV格式,文件名为2018-06-06-pdb-intersect-pisces-antibody2.csv,方便进行结构和序列的分析处理。
来源信息:数据来源于PDB数据库,经过了处理,提取了抗体相关的结构和序列信息。该数据集适合用于结构生物学和生物信息学研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于抗体结构与功能关系的研究,蛋白质结构预测、抗体设计、表位分析等研究。
行业应用:可以为生物制药行业提供数据支持,特别是在抗体药物研发、抗体优化、靶点识别等方面。
决策支持:支持生物技术公司和研究机构进行抗体相关项目的决策,加速药物研发进程。
教育和培训:作为结构生物学、生物信息学和计算生物学课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解抗体结构与序列的关联。
此数据集特别适合用于探索抗体结构与序列之间的关系,进而优化抗体设计,提升药物研发效率。