空间模式增强的细胞与组织识别_空间转录组学_数据集

数据集概述

本数据集为空间转录组学研究提供支持，包含用于验证SPECTRUM方法的模拟数据及R语言软件包。SPECTRUM方法结合已知细胞类型标记与空间加权，用于细胞类型识别和空间群落检测，数据集助力相关算法性能评估与复现。

文件详解

• simulate_MPOA_data.rds：R语言数据格式（.rds），模拟MPOA组织空间转录组数据
• simulate_MOB_data.rdata：R语言数据格式（.rdata），模拟MOB组织空间转录组数据
• simulate_Stereo_data.rdata：R语言数据格式（.rdata），模拟Stereo-seq技术空间转录组数据
• SPECTRUM_RPackage.zip：压缩文件格式（.zip），SPECTRUM方法的R语言软件包

适用场景

• 空间转录组学数据分析：验证细胞类型识别与空间群落检测算法性能
• 生物信息学方法研究：复现SPECTRUM方法的实验结果与分析流程
• 计算生物学教学：作为空间转录组数据分析算法实践的教学案例
• 组织微环境研究：通过模拟数据探索空间模式对细胞组织机制的影响