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帕金森病患者与健康对照者MTG靶向富集单核RNA测序数据集
2025年12月23日 30 145 129
数据集概述 本数据集包含帕金森病患者与健康对照者的人类中颞叶皮层（MTG）样本经靶向富集的单核RNA测序（snRNAseq）原始FASTQ数据，是PD5D队列研究的一部分，该队列还包含基因分型、单细胞ATACseq及空间转录组学等多组学数据。 文件详解 文件名称: scherzer-pmdbs-sn-rnaseq-mtg-...
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蓝斑多巴胺细胞空间转录组学数据集_GeoMx_对照组与帕金森病组
2025年12月23日 30 106 46
数据集概述 本数据集包含通过Nanostring GeoMx技术分析的对照组、早期帕金森病（ePD）和晚期帕金森病（lPD）受试者蓝斑TH+细胞的空间转录组数据，共分析39个感兴趣区域，提供原始与处理后计数及元数据的R Seurat对象，支持帕金森病相关分子机制研究。 文件详解 文件名称: vila-pmdbs-spatial-geomx-...
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空间模式增强的细胞与组织识别_空间转录组学_数据集
2025年12月19日 30 120 1
数据集概述 本数据集为空间转录组学研究提供支持，包含用于验证SPECTRUM方法的模拟数据及R语言软件包。SPECTRUM方法结合已知细胞类型标记与空间加权，用于细胞类型识别和空间群落检测，数据集助力相关算法性能评估与复现。 文件详解 simulate_MPOA_data.rds：R语言数据格式（.rds），模拟MPOA组织空间转录组数据...
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肾上腺皮质癌空间转录组学处理数据集
2025年12月15日 30 124 8
数据集概述 该数据集为人类肾上腺皮质癌（ACC）样本的空间转录组学处理数据，包含经10x Genomics Visium平台处理生成的图像文件与过滤后表达矩阵，支持研究肾上腺皮质癌组织的基因表达空间分布特征。 文件详解 该数据集包含9个文件，具体说明如下： - 过滤后表达矩阵文件（共3个，.gz格式）： -...
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同位素编码空间生物学识别淀粉样斑块年龄依赖性结构成熟与突触丢失数据集
2025年12月13日 30 202 159
数据集概述 本数据集是研究论文的补充数据，包含App NL-F/NL-F小鼠模型10个月和18个月龄的转录组数据（CSV格式）及MALDI质谱成像（MSI）数据（ZIP压缩包），涉及基因表达分析与质谱数据处理，为淀粉样斑块相关的空间生物学研究提供支持。 文件详解 转录组数据文件：...
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两种小鼠帕金森病模型纹状体空间转录组数据集
2025年12月12日 30 168 14
数据集概述 本数据集包含基于两种小鼠帕金森病（PD）模型的纹状体空间转录组（ST）数据，聚焦PD样病理不同阶段和机制下的细胞类型特异性及空间基因表达变化，为PD病理机制研究提供空间维度的基因表达数据支持。 文件详解 文件名称: cragg-mouse-spatial-visium-striatum_README.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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胰腺导管腺癌快速尸检样本IMC处理数据集_Cho_Y等
2025年12月12日 30 51 37
数据集概述 该数据集包含Cho Y等人研究中，胰腺导管腺癌（PDAC）原发及转移灶快速尸检样本的处理后单细胞数据，以RDS格式存储并附带注释，支持分析肿瘤微环境中的细胞邻域功能相关性。 文件详解 文件名称: backup_output.rds.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明:...
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帕金森病5D图谱中颞中回单核RNA测序数据集
2025年12月8日 30 131 29
数据集概述 该数据集包含来自帕金森病患者与健康对照者的九十四例人类颞中回样本的单核RNA测序（snRNAseq）原始FASTQ数据，属于帕金森病5D图谱的一部分，同一受试者还包含基因分型、单细胞ATACseq及空间转录组学等多组学数据。 文件详解 文件名称: scherzer-pmdbs-sn-rnaseq-mtg_README.pdf 文件格式:...
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正常肾上腺皮质空间转录组学处理数据集
2025年12月7日 30 72 69
数据集概述 该数据集包含人类正常肾上腺皮质的空间转录组学处理数据，涉及两个正常肾上腺样本。数据由Visium空间转录组技术生成，经Space Ranger软件处理，包含样本的图像文件与过滤后的表达矩阵，为研究肾上腺皮质的空间基因表达模式提供支持。 文件详解 该数据集包含18个文件，按样本分为表达矩阵文件和图像相关文件，具体如下： -...
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Scigenex_Based_基因表达分析与空间数据科学实践完整数据
2025年12月7日 30 168 46
数据集概述 该数据集是Scigenex R库提供的示例数据集子集，包含基因、空间等相关数据文件，用于展示库内函数和类的使用方法，同时提供生成示例数据的代码文件。 文件详解 数据文件（.rda格式）：共6个，包括pbmc3k_medium.rda、lymph_node_tiny_2.rda等，存储基因表达或细胞聚类相关数据...
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FFPE组织成像空间转录组平台系统性基准测试H5AD文件数据集
2025年12月7日 30 191 116
数据集概述 该数据集包含用于FFPE组织成像空间转录组平台系统性基准测试的H5AD文件压缩包，为相关技术平台的性能评估提供数据支持。 文件详解 文件名称：IST_benchmarking_H5AD.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：压缩包内包含与FFPE组织成像空间转录组平台系统性基准测试相关的H5AD格式文件，具体字段及内容需解压后查看...
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细胞聚类空间转录组学数据集CellClusteringforSpatialTranscriptomicsDataset-paramvir705
2025年4月25日 30 150 6
细胞聚类空间转录组学数据集CellClusteringforSpatialTranscriptomicsDataset-paramvir705 数据来源：互联网公开数据 标签：生物医学，细胞聚类，空间转录组学，基因表达，数据分析，机器学习，生物信息学，单细胞分析 数据概述：...
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单细胞空间转录组数据集HubmapDFDataset-selfdriving
2025年4月23日 30 93 14
单细胞空间转录组数据集HubmapDFDataset-selfdriving 数据来源：互联网公开数据 标签：单细胞测序，空间转录组学，数据集，生物医学，基因组学，机器学习，疾病研究，生物信息学 数据概述：该数据集由Hubmap项目提供，主要用于单细胞空间转录组学的研究，记录了人体组织中单个细胞的空间分布和基因表达数据。主要特征如下：...
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小鼠海马CA1区域pciSeq基因表达计数数据集-CA1DapiBoundaries-4-3-right切片-sandhya212
2025年4月21日 30 151 34
小鼠海马CA1区域pciSeq基因表达计数数据集-CA1DapiBoundaries-4-3-right切片-sandhya212 数据来源：互联网公开数据 标签：单细胞测序,pciSeq,基因表达,小鼠,海马,CA1区域,神经科学,空间转录组学 数据概述： 本数据集包含小鼠海马CA1区域的pciSeq（Qian...
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细胞聚类空间转录组学数据集
2025年4月15日 30 152 99
细胞聚类空间转录组学数据集 数据来源：互联网公开数据 标签：细胞聚类,空间转录组学,VNS算法,ILP模型,p-中位数分类,基因表达,空间坐标,数据挖掘,生物信息学 数据概述： 本数据集基于空间转录组学技术，聚焦于细胞聚类问题，通过结合基因表达矩阵和空间坐标信息，构建了一个基于p-...
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精确空间质心数据集
2025年4月14日 30 104 18
精确空间质心数据集 数据来源：互联网公开数据 标签：pciSeq,细胞坐标,小鼠脑,间质系统,神经科学,空间转录组学,数据可视化 数据概述： 本数据集包含使用pciSeq技术（Qian X....
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空间转录组学细胞聚类分析数据集
2025年4月14日 30 6 5
空间转录组学细胞聚类分析数据集 数据来源：互联网公开数据 标签：细胞聚类,空间转录组学,变量邻域搜索算法,VNS,整数线性规划,ILP,基因表达,空间坐标,转录组学分析 数据概述： 本数据集基于空间转录组学技术，通过变量邻域搜索（VNS）算法和整数线性规划（ILP）模型，对细胞聚类问题进行了系统性研究。数据集整合了基因表达矩阵和空间坐标信息，采用p-...
