数据集概述
本数据集为欧洲陆生蜗牛冰期避难所及冰期后扩张研究的关联数据,涉及4种肺螺类陆生蜗牛(Monachoides incarnatus、Helix pomatia、Helix thessalica、Caucasotachea vindobonensis)。包含系统地理学分析的输入文件、序列比对、分析设置及结果总结树,共17个文件,用于验证中欧森林蜗牛物种在北方避难所的生存假说。
文件详解
- 分析输入文件(.xml)
- 文件名称:如incarnatus1.xml、pomatiaII1.xml、thessalica1.xml、vindobonensis1.xml等共8个
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含线粒体数据的序列比对信息及连续系统地理学分析的设置参数,用于BEAST 1.10.4软件分析
- 结果总结树(.tree)
- 文件名称:如incarnatus_cauchy.tree、pomatiaII.tree、vindobonensis.tree、incarnatus.tree等共6个
- 文件格式:TREE
- 字段映射介绍:系统地理学分析结果的系统发育树,包含内部节点的地理定位信息,用于追溯冰期后扩张谱系的起源
- 分析日志(.log)
- 文件名称:incarnatus_strict_clocktest.mle.result.log、incarnatus_lognormal_clocktest.mle.result.log共2个
- 文件格式:LOG
- 字段映射介绍:时钟测试的最大似然估计结果日志,记录系统发育分析的参数估计值
- 说明文档(.txt)
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集文件说明,包含论文关联信息、文件清单及对应分析内容
数据来源
论文“In both directions: Expansions of European land snails to the north and south from glacial refugia”
适用场景
- 生物地理学研究:分析欧洲陆生蜗牛冰期避难所分布及冰期后南北向扩张路径
- 物种演化速率分析:利用线粒体序列时钟测试结果,研究蜗牛物种的分子演化速率
- 气候变化适应性研究:基于冰期避难所假说验证,探讨陆生蜗牛对气候变迁的追踪能力
- 系统发育地理模型验证:通过BEAST分析输入文件与结果树,验证连续系统地理学模型的应用效果