狂犬病病毒序列亲和传播聚类客观分类数据集

数据集概述

本数据集基于亲和传播聚类(AP)算法,对狂犬病病毒(RABV)全基因组序列进行标准化分类,结合系统发育分析验证聚类结果,为RABV及其他序列比较分析提供统一透明的聚类方法支持。

文件详解

  • 数据概览文件:
  • 00_Defining objective clusters for rabies virus_data_overview.csv:CSV格式,包含数据集文件目录及详细说明,字段包括文件名称、格式、软件使用等信息。
  • 序列数据文件:
  • pntd.0006182.s001.csv:CSV格式,可能包含狂犬病病毒序列核心数据。
  • pntd.0006182.s002.csv:CSV格式,包含病毒序列元数据,字段示例有名称、登录号、来源国家、物种、分离株ID、序列长度、分离年份、AP主聚类等。
  • 文档文件:
  • pntd.0006182.s003.pdf:PDF格式,可能为补充说明文档。
  • 图像文件:
  • pntd.0006182.s004.tiff:TIFF格式,可能为聚类结果或序列分析相关的图像文件。

适用场景

  • 病毒学研究:分析狂犬病病毒全球聚类分布及系统发育关系。
  • 生物信息学应用:验证亲和传播聚类算法在病毒序列分类中的有效性。
  • 传染病防控:为狂犬病病毒的溯源与传播路径分析提供标准化聚类方法。
  • 序列分析方法学:探索客观聚类算法在其他病原体序列比较中的应用。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.8 MiB
最后更新 2025年12月16日
创建于 2025年12月16日
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