数据集概述
本数据集围绕大肠杆菌长期进化实验（LTEE）展开，分析核心基因的进化特征。包含60株大肠杆菌共有的约2000个核心基因，对比其在实验中的突变情况与自然环境中的保守性，发现核心基因在LTEE中积累更多非同义突变，且受正选择的核心基因在自然中更保守，部分适应性突变可修饰蛋白功能。
文件详解
- 文件名称：README_for_DRYAD-LTEE-core-genome.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集包含的内容、分析脚本及结果，提及图4（突变结构映射）数据位于results/structure-mapping目录，R和Python脚本的使用方法在源代码中列出，需保留文件目录结构以确保脚本运行。
- 文件名称：DRYAD-LTEE-core-genome.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包文件，推测包含数据集的核心数据、分析脚本及结果文件，具体内容需解压后查看。
适用场景
- 微生物进化研究：分析大肠杆菌核心基因在长期实验中的突变模式及进化速率。
- 基因适应性进化分析：探究核心基因与非核心基因在选择压力下的突变差异。
- 蛋白质功能演化研究：研究适应性突变对蛋白质功能的修饰作用，而非仅导致功能缺失。
- 实验环境与自然环境基因进化对比：对比核心基因在LTEE实验环境与自然环境中的保守性差异。
- 进化生物学数据分析方法验证：利用数据集测试进化分析相关的R和Python脚本。
