数据集概述
本数据集围绕配体结合对蛋白质侧链构象异质性的影响展开，包含743对严格匹配的未结合（apo）与配体结合（holo）晶体学数据集的多构象建模结果，以及CDK2抑制剂结合结构的相关分析数据，可用于研究构象异质性的变化规律及与配体特性的关联。
文件详解
- 文件名称：qFit_PDBs
- 文件格式：无扩展名（推测为PDB格式文件集合）
- 字段映射介绍：包含蛋白质未结合与配体结合状态的多构象建模PDB文件，记录蛋白质侧链构象的空间分布信息。
- 文件名称：Supplementary_Table_3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充表格3，具体内容未明确，推测为与研究相关的补充统计数据或分析结果。
- 文件名称：SupplementaryTable1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充表格1，具体内容未明确，推测为研究中使用的晶体学数据集匹配信息或基础统计数据。
- 文件名称：Supplemetary_Table2.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Apo（未结合状态PDB ID）、Apo_Res（未结合状态分辨率）、Holo（结合状态PDB ID）、Holo_Res（结合状态分辨率）、Ligand（配体ID）、RMSD_outlier（RMSD异常值）、Ligand_Overlap（配体重叠情况）等字段，记录配体结合相关的结构与分析参数。
数据来源
论文“Ligand binding remodels protein side chain conformational heterogeneity”
适用场景
- 蛋白质构象异质性研究：分析配体结合对蛋白质侧链构象灵活性的影响及远程残基的构象变化规律。
- 配体特性与蛋白质相互作用分析：探究氢键数量、疏水性等配体性质与蛋白质构象异质性的关联。
- 药物设计辅助：基于CDK2抑制剂结合结构的构象异质性数据，优化抑制剂设计以调节结合亲和力。
- 生物大分子结构功能研究：整合静态构象变化与构象异质性数据，完善配体结合模型。
