数据集概述
本数据集是《Transcriptomics for clinical and experimental biology research: hang on a seq》论文的补充资料，包含生成论文图表的R脚本、源数据文件及额外图表，支持转录组学相关研究的复现与扩展分析。
文件详解
该数据集包含以下文件类型及内容：
- 代码文件：
- Omics_review_HC_final.R：R脚本文件，用于生成论文中的图表。
- 图表生成源数据文件：
- Fig1_upset_new_V2_general.type.csv：生成Figure 1的源数据文件，CSV格式。
- SMP_ENSG_biotypes_average_data_All_genes_V2.xlsx、FUSION_study_CPM-data_fusion_annotated.xlsx：生成Figure 2和3的源数据文件，XLSX格式。
- GSE47774_SEQC_ILM_BGI_Human_Brain_Only.xlsx：生成额外图表（RNA_review_figures_brain_HC.pdf）的源数据文件，XLSX格式。
- 原始计数数据文件：
- RNA-seq.B：GSE164471_GESTALT_Muscle_ENSG_counts_annotated.csv（CSV格式）
- RNA-seq.C：GSE97084_Robinson_GeneCount_raw.tsv、GSE97084_Robinson_GeneCount_raw_2.tsv（TSV格式）
- RNA-seq.D：GSE157585_Kulkarni_Peck_et_al_MASTERS_raw_counts.txt（TXT格式）
- RNA-seq.E：GSE151066_Rubenstein_rsem_genes_count.csv（CSV格式）
- HTA2.0 array：SMP191_iron_output_M_GC-HTA_ENST_Grch38_25.500.25.10_log2_2_minimum.csv（CSV格式）、ENSG_biotypes_RNA_review_SMP_data.xlsx（XLSX格式）
- 额外图表文件：
- RNA_review_figures_brain_HC.pdf：PDF格式的额外图表文件。
适用场景
- 转录组学研究复现：用于复现论文中关于临床与实验生物学转录组学的分析结果。
- 生物信息学方法验证：验证R脚本在转录组数据分析中的应用流程。
- 转录组学数据扩展分析：基于原始计数数据开展新的转录组学相关研究。
- 学术论文补充资料参考：为相关领域研究者提供转录组学研究的补充数据支持。
