数据集概述
本数据集聚焦西班牙滨螺(Littorina saxatilis)的平行生态物种形成研究,包含三个不同地点潮间带个体的ddRAD测序数据,涉及4256个SNP标记,分析了地理隔离对基因组分化平行性的影响,以及中间表型个体的杂交情况,揭示地理分离是基因组分化的主要来源。
文件详解
- 文件名称:Kess Galindo Boulding Lsaxatilis 2018 EE Upload Data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含西班牙滨螺不同潮间带(上、中、下)个体的ddRAD测序数据,涉及4256个SNP标记,可用于FDIST、STRUCTURE、AMOVA等基因组分析,具体字段需解压后查看原始数据结构。
数据来源
论文“Genomic divergence between Spanish Littorina saxatilis ecotypes unravels limited admixture and extensive parallelism associated with population history”
适用场景
- 海洋生物平行生态物种形成研究:分析地理隔离对西班牙滨螺生态型基因组分化平行性的影响。
- 基因组分化机制探索:通过SNP标记研究不同地理距离位点间的基因流与分化位点共享模式。
- 杂交个体鉴定:验证表型中间个体的基因组杂交信号,评估壳性状作为杂交标记的可靠性。
- 群体遗传结构分析:利用STRUCTURE和AMOVA解析地理分离、生态型对基因组分化的贡献。