lncRNA与miRNA相互作用预测数据集lncRNA-miRNAInteractionPredictionDataset-prathamsahay
数据来源:互联网公开数据
标签:lncRNA, miRNA, 基因组学, 生物信息学, 深度学习, 相互作用预测, 基因调控, 数据挖掘
数据概述:
该数据集包含来自生物信息学研究的数据,记录了lncRNA(长链非编码RNA)与miRNA(微小RNA)之间的相互作用关系,以及相关的特征信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间范围,通常用于静态分析和模型训练。
地理范围:数据未限定特定地理区域,适用于普遍的生物学研究。
数据维度:包括lncRNA和miRNA的配对信息,以及它们之间的相互作用标签(label),同时包含了lncRNA的多种特征,例如Degree(度)、Betweenness(中介中心性)和Embedding(嵌入向量)。
数据格式:主要以CSV格式提供,文件名为final_dataset.csv和metric_evaluation_data (1).csv,便于数据分析和模型构建。另外,还包括pickle格式的mirna_stack.pickle和new_new_mirna_stack_final.pickle文件,可能包含更复杂的数据结构或预处理结果。
来源信息:数据集来源于生物信息学领域的研究,经过了数据清洗和特征工程,适用于模型训练和评估。
该数据集适合用于lncRNA与miRNA相互作用的预测,以及相关生物学机制的研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、基因组学领域的学术研究,例如lncRNA-miRNA相互作用预测模型的构建、lncRNA功能研究、miRNA调控机制分析等。
行业应用:可以为生物医药行业提供数据支持,特别是在药物靶点发现、疾病诊断和治疗方案设计方面。
决策支持:支持科研人员进行生物学实验设计、结果分析,以及相关领域的技术决策。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等相关课程的实训材料,帮助学生和研究人员深入理解lncRNA与miRNA的相互作用机制,以及相关的预测方法。
此数据集特别适合用于探索lncRNA与miRNA相互作用的规律,构建预测模型,并深入研究lncRNA在基因调控中的作用,从而实现对疾病发生发展机制的理解,并为相关治疗提供理论依据。