数据集概述
本数据集围绕鲈形目隆头鱼亚目咽颌(pharyngognathy)这一关键演化创新展开,包含基于188种棘鳍鱼类10个核基因座的系统发育分析结果,以及咽颌功能形态学调查数据,旨在探究咽颌的演化历史与多样化机制。
文件详解
- 文件名称:labroidALL.nex
- 文件格式:NEXUS(.nex)
- 内容说明:可能为包含多基因序列的系统发育分析输入文件,用于构建隆头鱼亚目及近缘类群的进化树
- 文件名称:labroid30part.xml
- 文件格式:XML(.xml)
- 内容说明:可能为系统发育分析的分区设置文件,定义不同基因或基因区域的进化模型参数
- 文件名称:labroidALL_30part.txt
- 文件格式:文本文件(.txt)
- 内容说明:基因序列分区信息文件,包含ENC、glyt、myh等基因的1st/2nd/3rd密码子位点划分(如ENC1st=1-810\3)
- 文件名称:Supplemental Table 1-Final.pdf
- 文件格式:PDF(.pdf)
- 内容说明:补充数据表文档,可能包含系统发育分析的物种列表、基因信息或形态学特征数据
- 文件名称:labroidRAxML_script
- 文件格式:无扩展名脚本文件
- 内容说明:可能为使用RAxML软件进行最大似然法系统发育分析的运行脚本
- 文件名称:labroidALL.phy
- 文件格式:PHYLIP(.phy)
- 内容说明:可能为PHYLIP格式的基因序列文件,用于系统发育分析软件的输入
适用场景
- 鱼类系统发育研究:分析隆头鱼亚目及近缘类群的分类地位与演化关系
- 进化创新机制研究:探究咽颌结构对鱼类食性适应与生态位分化的影响
- 功能形态学分析:比较不同鱼类类群咽颌的形态特征与力学功能差异
- 分子进化分析:基于多基因序列数据研究鱼类核基因的进化速率与选择压力