数据集概述
本数据集为论文“Transcriptional changes in potato sprouts upon interaction with Rhizoctonia solani indicate pathogen induced interference in the defence pathways of potato”的补充材料，包含4个Excel文件，记录马铃薯与立枯丝核菌互作过程中的转录组相关数据，支持植物病理防御通路干扰机制的研究。
文件详解
- 补充文件S1 - Annotation.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含转录组数据的注释信息（具体字段未提供预览，推测为基因注释、功能分类等基础信息）
- 补充文件S2 - RPKM values.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因表达的RPKM（每千碱基转录本每百万映射 reads 数）定量值
- 补充文件S3 - DESeq output_R1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含DESeq差异表达分析的输出结果（推测含差异倍数、显著性水平等统计信息）
- 补充文件S4 - Heatmaps.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因表达热图相关数据（推测为用于可视化的表达量矩阵或聚类结果）
数据来源
论文“Transcriptional changes in potato sprouts upon interaction with Rhizoctonia solani indicate pathogen induced interference in the defence pathways of potato”（作者：Rita Zrenner等）
适用场景
- 植物病理机制研究：分析马铃薯与立枯丝核菌互作过程中的转录组变化，探究病原菌对植物防御通路的干扰机制
- 差异基因表达分析：基于RPKM值和DESeq输出结果，筛选和验证互作过程中的关键差异表达基因
- 基因功能注释研究：利用注释文件解析差异基因的功能分类与生物学通路富集
- 转录组数据可视化：通过热图数据呈现基因表达模式的聚类特征与表达量变化趋势
