数据集概述
本数据集为论文“Transcriptomic Profiling Does Not Refine Mastocytosis Diagnosis”的补充数据,包含肥大细胞增多症患者队列特征、转录组读数计数、差异表达分析结果、相关性分析结果等内容,用于支撑转录组分析无法优化肥大细胞增多症诊断的研究结论,共9个文件。
文件详解
- 队列特征文件
- 文件名称:Supplementary_Data_cohort_characteristics_Suppl_Table_1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录肥大细胞增多症患者队列的临床及基础特征信息
- 转录组读数计数文件
- 文件名称:Supplementary_Data_read_counts_all_cpm_filt_TMMnorm_Suppl_Table_7.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含经过滤和TMM标准化后的转录组每百万读数(CPM)数据
- 差异表达分析文件
- 文件名称示例:Supplementary_Data_AHN_subtype_DE_Suppl_Table_2.xlsx、Supplementary_Data_Midostaurin_DE_Suppl_Table_5.xlsx、Supplementary_Data_edgeRoutput_DE_all_Suppl_Table_4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:涵盖不同亚型、药物相关及整体样本的差异表达分析结果
- 相关性分析文件
- 文件名称:Supplementary_Data_cpm_filt_TMMnorm_lab_values_Pearson_Spearman_r_min65_Suppl_Table_6.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含转录组数据与实验室指标的Pearson、Spearman相关性分析结果
- 离群值分析文件
- 文件名称:Supplementary_Data_outlier_removal_comparison_as_table_Suppl_Table_8.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录离群值去除前后的对比分析数据
- 图表说明文件
- 文件名称:Supplementary_Data_Figure_legends.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含论文中相关图表的图例说明
数据来源
论文“Transcriptomic Profiling Does Not Refine Mastocytosis Diagnosis”
适用场景
- 肥大细胞增多症诊断研究: 分析转录组特征与疾病诊断的关联性,验证转录组分析对诊断的价值
- 血液肿瘤转录组分析: 探究肥大细胞增多症患者的基因表达模式及差异表达基因功能
- 临床队列特征研究: 基于队列特征数据开展患者临床表型与转录组特征的关联分析
- 药物疗效转录组评估: 分析Midostaurin药物相关的基因表达差异,研究药物作用机制
- 生物信息学方法验证: 利用离群值处理、标准化等数据,验证转录组分析方法的可靠性