数据集概述
本数据集包含25组Kv1.3通道与Tk-hefu肽类似物复合物的分子动力学(MD)模拟快照,记录模拟初始(0ns)和结束(110ns)状态,同时附带2份通道与肽间分子间相互作用分析的Excel表格,为钾离子通道阻滞剂研究提供结构动态数据支持。
文件详解
- 压缩文件(Kv1.3_Tk-hefu-deriv_complexes.zip)
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含25个复合物系统的分子动力学模拟快照文件,每个系统含溶剂化脂质 bilayer、通道及肽在0ns和110ns的状态,快照文件为*.gro格式
- 补充表格文件(Supplementary-Table-S2.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:所有系统动力学过程中通道与肽间分子间相互作用分析表
- 补充表格文件(Supplementary-Table-S3.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:所有系统动力学过程中通道与肽间分子间相互作用分析表
数据来源
Frontiers in chemistry网站补充信息
适用场景
- 钾离子通道阻滞剂结构设计: 分析Tk-hefu肽类似物与Kv1.3通道的结合模式,优化肽类阻滞剂结构
- 分子动力学模拟结果验证: 对比模拟初始与结束状态的结构变化,验证模拟体系的稳定性与合理性
- 分子间相互作用机制研究: 通过相互作用分析表格,解析通道与肽结合的关键作用力类型及位点
- 药物研发辅助: 为基于ɑ-hairpinin支架的钾离子通道阻滞剂研发提供动态结构数据支撑