数据集概述
本数据集为河流环境DNA(eDNA)样本经DADA2去噪后的扩增子序列变体(ASVs)表格数据,包含三种分子标记(12S、18S、COI)的处理结果及元数据文档,共4个文件,用于河流生物多样性相关研究。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共3个)
dada_seqtab_COI_stoten.csv:COI标记的ASVs表格,包含样本(PS1-PS6、L1-L12P等)及空白对照的序列变体计数,行索引为ASV序列,列索引为样本编号
dada_seqtab_18S_stoten.csv:18S标记的ASVs表格,结构同COI文件,包含对应样本的序列变体计数
dada_seqtab_12S_stoten.csv:12S标记的ASVs表格,结构同前两类文件,包含对应样本的序列变体计数
- 文档文件(DOCX格式,共1个)
STOTEN_Metadata.docx:数据集元数据文档,记录样本背景、实验设计等相关信息
适用场景
- 河流生物多样性监测:通过三种分子标记的ASVs数据,分析河流生态系统中的物种组成与分布
- 环境DNA宏条形码技术应用:验证DADA2去噪流程在河流eDNA样本中的处理效果
- 分子标记比较研究:对比12S、18S、COI三种标记在河流生物多样性检测中的覆盖度与特异性
- 水生生态环境评估:结合元数据,分析河流环境因子与生物群落结构的关联