Metabarcoding_Based_河流eDNA样本DADA2处理ASVs表格数据

数据集概述

本数据集为河流环境DNA(eDNA)样本经DADA2去噪后的扩增子序列变体(ASVs)表格数据,包含三种分子标记(12S、18S、COI)的处理结果及元数据文档,共4个文件,用于河流生物多样性相关研究。

文件详解

  • 数据文件(CSV格式,共3个)
  • dada_seqtab_COI_stoten.csv:COI标记的ASVs表格,包含样本(PS1-PS6、L1-L12P等)及空白对照的序列变体计数,行索引为ASV序列,列索引为样本编号
  • dada_seqtab_18S_stoten.csv:18S标记的ASVs表格,结构同COI文件,包含对应样本的序列变体计数
  • dada_seqtab_12S_stoten.csv:12S标记的ASVs表格,结构同前两类文件,包含对应样本的序列变体计数
  • 文档文件(DOCX格式,共1个)
  • STOTEN_Metadata.docx:数据集元数据文档,记录样本背景、实验设计等相关信息

适用场景

  • 河流生物多样性监测:通过三种分子标记的ASVs数据,分析河流生态系统中的物种组成与分布
  • 环境DNA宏条形码技术应用:验证DADA2去噪流程在河流eDNA样本中的处理效果
  • 分子标记比较研究:对比12S、18S、COI三种标记在河流生物多样性检测中的覆盖度与特异性
  • 水生生态环境评估:结合元数据,分析河流环境因子与生物群落结构的关联
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 79.0 MiB
最后更新 2026年1月14日
创建于 2026年1月14日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。