数据集概述
本数据集基于高通量测序技术,针对法国布列塔尼某海湾22个月的浮游生物样本开展宏条形码分析,用于检测底栖外来物种的浮游幼虫阶段,监测其生命周期动态。数据包含定制参考数据库、物种信息及分析流程文件,可支持海洋外来物种早期检测与管理研究。
文件详解
- Species_AccessionNumber.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含研究涉及的外来物种及其对应的分子参考序列登录号信息
- Pipeline_Metabarcoding.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:宏条形码分析流程相关的压缩文件,可能包含分析脚本、参数配置等内容
- CustomReference_database_COI.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:基于COI分子标记构建的定制参考数据库,包含目标外来物种的序列信息
- CustomReference_database_18S.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:基于18S分子标记构建的定制参考数据库,包含目标外来物种的序列信息
数据来源
论文“Data from: Metabarcoding on planktonic larval stages: an efficient approach for detecting and investigating life cycle dynamics of benthic aliens”
适用场景
- 海洋外来物种早期检测: 利用宏条形码技术识别浮游幼虫阶段的底栖外来物种,实现早期预警
- 外来物种生命周期动态研究: 分析外来物种幼虫阶段的 temporal dynamics,探究其繁殖周期与扩散模式
- 分子监测方法验证: 对比宏条形码与传统形态学/单一个体条形码方法的检测效果,评估技术可靠性
- 海洋生物多样性管理: 为欧洲海洋战略框架指令等管理策略提供外来物种监测数据支持
- 定制参考数据库应用研究: 分析定制数据库相比公共数据库在目标物种检测中的优势