数据集概述
本数据集通过基于序列的关联分析,探究牛MGST1基因表达数量性状位点(eQTL)对牛奶成分的多效性影响。包含六个压缩文件,涵盖不同群体的测序数据及补充文件,支持相关遗传机制研究。
文件详解
- RNAseq_pop_imputed_seq_data.zip:ZIP格式,RNA测序群体的插补序列数据压缩包
- Large_pop_imputed_seq.zip:ZIP格式,大群体的插补序列数据压缩包
- RNAseq_pop_imputed_seq_data_with_gap_vars.zip:ZIP格式,含gap变量的RNA测序群体插补序列数据压缩包
- GWAS_pop_data.zip:ZIP格式,全基因组关联分析(GWAS)群体数据压缩包
- Supplementary_files.zip:ZIP格式,补充文件压缩包
- RNAseq_pop_del_haplotype.zip:ZIP格式,RNA测序群体缺失单倍型数据压缩包
数据来源
论文“Sequence-based association analysis reveals an MGST1 eQTL with pleiotropic effects on bovine milk composition”
适用场景
- 牛分子育种研究:分析MGST1基因eQTL对牛奶成分的遗传调控机制,辅助奶牛遗传改良
- 数量遗传学分析:探究基因多效性在复杂性状(牛奶成分)中的作用模式
- 基因组学数据整合:整合不同群体测序数据与GWAS结果,开展跨群体关联验证
- 奶牛功能基因组学:解析牛奶成分相关基因的表达调控及分子机制