数据集概述
本数据集包含为家猫开发的MHC相关微卫星标记,以及利用这些标记评估家猫(澳大利亚混种和纯种缅甸猫)、猎豹和吉尔狮子MHC多样性的数据。数据涉及微卫星标记开发结果、不同猫科动物群体的MHC多样性分析,可用于研究猫科动物免疫遗传多样性与种群健康的关系,共包含4个文件。
文件详解
- 狮子MHC序列文件
- 文件名称:lionsequencesfordryad.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含狮子MHC基因序列数据,以序列ID(如>PaleIaI*01)开头,后接核苷酸序列
- 猎豹MHC序列文件
- 文件名称:cheetahsequencesfordryad.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含猎豹MHC基因序列数据,格式与狮子序列文件一致
- 猎豹微卫星数据文件
- 文件名称:cheetah_microsatellite_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含猎豹群体的MHC相关微卫星标记检测数据
- 综合微卫星数据文件
- 文件名称:Micosatellite_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含家猫(混种及缅甸猫)、猎豹、吉尔狮子的MHC相关微卫星标记检测数据,用于多样性分析
数据来源
论文“Development of MHC-linked microsatellite markers in the domestic cat and their use to evaluate MHC diversity in domestic cats, cheetahs and Gir lions”
适用场景
- 猫科动物免疫遗传学研究: 分析家猫、猎豹、吉尔狮子等猫科动物的MHC遗传多样性,探究免疫相关基因的进化规律
- 种群健康评估: 通过MHC多样性数据评估不同猫科动物种群的免疫适应能力与健康状况
- 微卫星标记应用验证: 验证为家猫开发的MHC相关微卫星标记在其他猫科动物中的适用性
- 保护遗传学研究: 为猎豹、吉尔狮子等濒危猫科动物的保护策略制定提供遗传多样性数据支持