数据集概述
本数据集包含对PRJNA977416项目原始数据进行宏基因组Galaxy工作流分析的输出结果，涵盖分类学注释、功能信息及相关元数据与分析工作流文件，为蜜蜂肠道微生物组研究提供多维度数据支持。
文件详解
该数据集包含12个文件，具体说明如下：
- 元数据文件：
- PRJNA977416_metadata.csv：CSV格式，包含实验设计、样本信息等元数据，字段示例：Experiment_LIBRARY_STRATEGY（实验文库策略）、SAMPLE_organism（样本生物）、RUN_@accession（运行编号）
- 分类学分析文件：
- Kraken2_Reports.zip：ZIP格式，Kraken2分类器的所有样本报告
- Bracken_Reports.zip：ZIP格式，Bracken分类器的所有样本报告
- MetaPhlan_Reports.zip：ZIP格式，MetaPhlan分类器的所有样本报告
- Kraken_Bracken_Standardised_Taxonomy.tabular：tabular格式，经Taxpasta标准化的Kraken+Bracken分类丰度合并文件
- MetaPhlan_Standardised_Taxonomy.tabular：tabular格式，经Taxpasta标准化的MetaPhlan分类丰度文件
- Bracken_Alpha_diversity.tabular：tabular格式，基于Bracken标准化丰度的α多样性指标文件
- Kraken_Bracken_Krona_Diversity.html：HTML格式，Kraken+Bracken分类组成的Krona交互式可视化图
- MetaPhlan_Krona_Diversity.html：HTML格式，MetaPhlan分类组成的Krona交互式可视化图
- 功能分析文件：
- HUMAnN_GO_terms.tabular：tabular格式，所有样本的GO术语相对丰度表
- HUMAnN_Genes_Pathways.zip：ZIP格式，包含检测到的通路和基因家族详情的目录
- 分析工作流文件：
- Galaxy-Workflow.ga：.ga格式，用于分析的Galaxy工作流文件
适用场景
- 蜜蜂肠道微生物组分类学组成分析：比较不同分类器（Kraken2、Bracken、MetaPhlan）的注释结果
- 微生物多样性研究：基于α多样性指标探究蜜蜂肠道菌群的群落多样性特征
- 功能基因组学分析：解析蜜蜂肠道微生物的GO功能注释及代谢通路分布
- 宏基因组分析方法复现：利用Galaxy工作流文件重复或优化蜜蜂肠道微生物组分析流程
