数据集概述
本数据集包含北美西部猩红色猴面花（Mimulus cardinalis）的基因表达可塑性分析数据及R脚本，用于研究高温调控基因表达的空间变异与气候变化下可塑性进化的关系。数据基于不同纬度、年份（2010和2017）样本在两种热环境下的转录组分析，验证表型可塑性随气候变暖的进化模式，共含32个文件。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称：SampleInfo.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含样本名称（SampleName）、种群（Population）、年份（Year）、温度（Temp）等样本基本信息。
- 差异基因表达文件
- 文件名称：如UpSharedDEGsAcrossTemp_FoldChange.csv、DOWN_in_S2017_EvsF.csv、HeatUp_40_S_N2017.csv等
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含基因（Gene）、分组（Group）、折叠变化（FoldChange）、表达差异（ExpressionDifference）等基因表达分析结果，覆盖不同种群、年份、温度处理下的差异表达基因数据。
- 种群气候数据文件
- 文件名称：Population_localities_climateNA_output_2010-2017MSY.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含种群分布地的气候相关数据，用于关联基因表达与气候因子。
- 标准化计数文件
- 文件名称：BCP-93-Preston-DESeq2_norm_counts.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含DESeq2标准化后的基因表达计数数据。
- 说明文档
- 文件名称：READ_ME_FILE.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集的说明文档，包含数据背景、文件说明等内容。
数据来源
标题为“Mimulus cardinalis plasticity analyses and R scripts for: Spatial variation in high temperature-regulated gene expression predicts evolution of plasticity with climate change in the scarlet monkeyflower”的研究
适用场景
- 气候变化适应性研究: 分析基因表达可塑性随气候变暖的进化模式，验证空间变异对时间适应性的预测作用。
- 基因表达可塑性分析: 研究不同种群、年份、温度处理下的基因表达差异及可塑性变化。
- 种群遗传与气候关联分析: 结合种群分布地气候数据，探究基因表达与气候因子的关系。
- 转录组数据分析方法应用: 基于提供的R脚本和标准化数据，开展差异基因表达分析的方法学研究。
