找到28个数据集

标签: DESeq2

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  • Cress_Under_Stress_植物基因表达分析项目数据

    2026年2月9日 30 195 38

    数据集概述 本数据集为"Cress Under Stress"(水芹胁迫)项目的最终学年项目数据,包含基因表达分析、候选基因筛选、聚类分析等相关的代码脚本与数据文件。数据涉及基因表达差异分析、聚类、热图绘制、qPCR验证等生物学研究内容,支持植物胁迫响应相关的基因功能研究。 文件详解 代码文件(.r)...
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  • 多组学揭示重度肥胖的关键炎症驱动因素_转录组学数据分析

    2026年1月31日 30 137 3

    数据集概述 本数据集为论文“Multiomics reveal key inflammatory drivers of severe obesity: IL4R, LILRA5, and OSM”的转录组学发现分析全汇总统计数据,记录了CCHC参与者中严重肥胖(BMI≥40 kg/m²)与健康对照(BMI<25...
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  • Mimulus_Based_气候变化下基因表达可塑性进化分析数据

    2026年1月28日 30 11 10

    数据集概述 本数据集包含北美西部猩红色猴面花(Mimulus cardinalis)的基因表达可塑性分析数据及R脚本,用于研究高温调控基因表达的空间变异与气候变化下可塑性进化的关系。数据基于不同纬度、年份(2010和2017)样本在两种热环境下的转录组分析,验证表型可塑性随气候变暖的进化模式,共含32个文件。 文件详解 样本信息文件...
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  • Insulin_NPPC_犬肌肉基因表达与血浆CNP水平研究数据

    2026年1月28日 30 173 164

    数据集概述 本数据集为犬胰岛素输注实验相关数据,记录了基础状态与胰岛素刺激状态下犬骨骼肌基因表达及血浆激素水平变化。核心内容是通过RNA测序识别差异表达基因,重点关注编码C型利钠肽的NPPC基因,同时包含血浆N端前C型利钠肽浓度数据,为胰岛素对肌肉分泌CNP的调控机制研究提供支持。 文件详解...
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  • Dromiciops_Based遗袋貂冬眠保护功能适应性转录组数据

    2026年1月27日 30 177 101

    数据集概述 本数据集包含遗袋貂(Dromiciops gliroides)冬眠期间的功能转录组学分析相关文件,涵盖差异表达基因、原始计数、DESeq2分析结果及组装转录组,与发表于《Molecular Ecology》的手稿相关联。数据集共包含四个文件,支持冬眠适应性保护功能的基因调控研究。 文件详解 组装转录组文件...
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  • TGIRT_seq_Based炎症性乳腺癌肿瘤与血液样本转录组分析补充数据

    2026年1月21日 30 210 65

    数据集概述 本数据集为炎症性乳腺癌肿瘤与血液样本TGIRT-seq分析的补充文件,包含测序数据的比对统计、差异表达分析、峰值检测及IDR分析结果,揭示转录增强对RNA剪接和血浆内含子RNA的影响,共含1个文件。 文件详解 文件名称:SupplementalFile.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含四类分析结果: 比对统计(mapping...
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  • Paramecium_Sexual_Cycle_核间串扰与基因组重排研究数据

    2026年1月20日 30 50 24

    数据集概述 本数据集围绕草履虫(Paramecium tetraurelia)有性周期中多细胞核的功能协调展开,通过RNA深度测序和转录组分析,探究老细胞核对新细胞核发育的调控机制,以及基因表达与程序性基因组重排(PGR)的关联。数据集包含9个相关文件,支持对核间串扰及基因调控过程的研究。 文件详解...
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  • DMY_Based_RNA_Seq与small_RNA_Seq处理文件及分析代码数据

    2026年1月18日 30 50 23

    数据集概述 本数据集包含DMY相关RNA-Seq和small RNA-Seq的处理文件与分析代码,涉及基因与miRNA的计数、表达量(FPKM/RPM)、差异分析结果及可视化脚本等,支持生物医学领域基因表达相关研究,共15个文件。 文件详解 基因表达数据文件...
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  • Pisum_sativum_Transcriptomic_atlas_豌豆转录组图谱数据

    2026年1月18日 30 134 24

    数据集概述 本数据集整合了来自7项国际研究的149个公开RNA-seq文库,覆盖10个豌豆品种的81种生物条件(包括植物器官、非生物胁迫、生物互作等)。数据基于豌豆参考基因组重新组装,计算生物重复的平均表达值,包含44756个基因的表达信息,为豌豆转录组研究提供全面参考。 文件详解...
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  • Boles等人的DSS时间序列数据集_基于小鼠结肠炎模型_研究脑与结肠基因网络失调的配套数据

    2026年1月17日 30 44 43

    数据集概述 本数据集为结肠炎小鼠模型研究的配套数据,包含脑与结肠样本的基因共表达模块富集分析、基因水平信息、非测序原始数据及各脑区不同时间点与对照组的差异表达分析结果,支持研究肠道 leaky gut 对脑内免疫激活、氧化应激及髓鞘化相关基因网络的调控机制。 文件详解 基因共表达与富集分析文件...
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  • Gene_biomarkers_Based_斑马鱼胚胎甲状腺干扰活性评估数据_研究结果

    2026年1月14日 30 86 64

    数据集概述 本数据集基于OECD 236指南,对斑马鱼胚胎暴露于甲状腺活性化合物(T3、6-PTU、MMI、IOP)后的基因表达进行研究,包含RNA测序后的质控报告、差异基因表达分析结果及功能富集分析结果,用于识别甲状腺相关基因表达模式,支持甲状腺干扰活性评估。 文件详解 results.zip 文件格式:ZIP...
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  • Acute_stress_Based_人类急性应激下RNA剪接与蛋白质分泌研究补充数据

    2026年1月14日 30 21 11

    数据集概述 本数据集是论文《Acute stress triggers RNA splicing and protein secretion in...
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  • RNAseq_Based_MCMV感染后唾液腺IL10阳性与阴性CD4_T细胞转录组数据

    2026年1月13日 30 118 59

    数据集概述 本数据集为MCMV感染后第14天,唾液腺中IL10阳性与IL10阴性CD4+ T细胞的Bulk RNAseq差异分析结果。通过DESeq2工具处理,呈现两组细胞的基因表达差异数据,为研究病毒感染后免疫细胞功能调控提供转录组层面的参考。 文件详解 文件名称:pos_vs_neg.all.featurecount.annotated.xlsx...
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  • HER2_breast_carcinomas_抗Yo副肿瘤性小脑变性免疫遗传特征补充数据

    2026年1月13日 30 147 13

    数据集概述 本数据集为HER2驱动乳腺癌触发抗Yo副肿瘤性小脑变性(Yo-PCD)相关研究的补充表格与基因表达数据,包含差异基因表达分析结果、基因本体富集分析结果及基因计数、转录本每百万读数(TPM)数据,共5个文件,支持对该疾病免疫遗传机制的深入研究。 文件详解 差异基因表达分析结果 文件名称:eTable 1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Developmental_transcriptomics_熊蜂拟态颜色变异基因网络研究数据

    2026年1月12日 30 44 40

    数据集概述 本数据集聚焦熊蜂拟态颜色变异的遗传机制研究,通过组织/阶段特异性转录组分析及qRT-PCR验证,揭示Hox基因Abd-B下游调控颜色模式分化的基因网络,包括中间发育基因、黑色素与氧化还原相关基因等,涉及昆虫褐黑素合成相关潜在基因,为理解熊蜂颜色模式发育及适应性表型辐射提供数据支持。 文件详解...
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  • Helicoverpa_armigera_Based棉铃虫迁徙飞行活动全基因组转录特征研究数据

    2026年1月12日 30 14 2

    数据集概述 本数据集聚焦全球入侵害虫棉铃虫的迁徙飞行活动,通过系留飞行实验与转录组测序技术,分析不同飞行表型个体的全基因组转录特征。包含飞行距离表型数据、基因表达矩阵、差异表达分析结果及功能注释等文件,揭示迁徙飞行相关的基因表达变化,为昆虫迁徙分子机制研究提供基础数据。 文件详解 飞行表型数据 文件名称:flight_mill_total...
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  • DESeq2_SMUL_Based施氏假单胞菌Py_PCE与Py_Fum转录组差异分析结果数据

    2026年1月11日 30 47 45

    数据集概述 本数据集包含使用DESeq2工具分析施氏假单胞菌(S. multivorans)Py_PCE_minus_Tex(A、B重复)与Py_Fum_minus_Tex(A、B重复)样本间基因表达差异的结果。数据集仅包含一个文件,无目录层级,无训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的拆分。 文件详解...
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  • Phoenix_dactylifera_Based_椰枣品种NaCl胁迫转录组响应补充表格数据

    2026年1月11日 30 170 150

    数据集概述 本数据集为椰枣品种转录组响应研究的补充表格,包含Khalas和Sultana两个椰枣品种在NaCl胁迫下的转录组分析数据。实验通过盆栽培养椰枣幼苗,设置非盐胁迫和盐胁迫处理,采集根和茎组织进行RNA测序及生物信息分析,以探究其耐盐分子机制。 文件详解 文件名称:Palms_Pongrac_Fischer_White et...
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  • Supplementary_tables_Lavin_KM研究_骨骼肌活检WGCNA模块及基因分析数据

    2026年1月2日 30 150 19

    数据集概述 本数据集为Lavin, KM等人研究的补充表格集合,包含7个Excel文件,内容涉及骨骼肌活检样本的WGCNA模块特征、模块成员基因列表、核心基因(Hubs)以及与肌纤维类型相关的单基因分析结果,支持骨骼肌基因表达与肌纤维特性的关联研究。 文件详解 Table S1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 草地贪夜蛾两种宿主品系转录差异研究数据集

    2025年12月21日 30 73 7

    数据集概述 本数据集为草地贪夜蛾两种宿主品系转录差异研究的配套数据与脚本,包含产卵实验、互惠移植实验的原始数据,以及用于数据分析的R脚本、bash脚本和补充说明文档,支持复现相关实验结果与差异表达分析。 文件详解 数据文件: Data_Ovip.txt:TXT格式,存储产卵实验数据,包含品系、条件、产卵数等字段...
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