数据集概述
本数据集为《膜翅目进化历史》论文的补充数据，包含基因序列比对、系统发育分析数据集、决定性数据集、四簇似然映射分析数据及系统发育树结果等，支持膜翅目系统发育关系与进化历史的研究。
文件详解
- 1-Gene-MSAs_after-pal2nal文件夹：氨基酸（aa）和核苷酸（nt）序列的同源基因多序列比对文件，为序列比对优化后的数据。
- 2-Main-dataset_dataBlocks-PartitionfinderResults-Final-supermatrix文件夹：
- 主数据集：phylip格式的串联超级矩阵（含aa和nt数据），按数据块划分；对应数据块文本文件；PartitionFinder分析的最佳分区方案（RAxML格式）；含“reduced”名称的文件为自动过滤后的比对和分区文件。
- 3-datasets_decisive-datasets文件夹：与2）结构一致，但为去除缺失数据的决定性数据集（Aculeata、Apoidea、Backbone三类）。
- 4-datasets_FCLM_and_permutations文件夹：四簇似然映射（FCLM）分析用数据集，含RAxML格式分区文件、分类群文件及置换分析相关数据。
- 5-results_rogue_taxa_analyses文件夹：RogueNaRok软件的 rogue taxa 分析结果文件（含aa和nt数据集结果）。
- 6-results_tree_reconstruction_decisive_datasets文件夹：决定性数据集的系统发育树结果（Newick格式）。
- 7-results_FCLM_and_permutations文件夹：FCLM分析结果文件（SVG格式图形文件）。
- 8-results_tree-reconstruction_main_analysis文件夹：主分析的系统发育树结果（Newick格式）。
- 9-dating_dataset_and_results文件夹：时间校准分析的输入与结果文件。
- 压缩包文件：Peters-et-al_Hymenoptera-additional-data.zip（.zip格式），为数据集压缩包。
适用场景
- 膜翅目系统发育关系研究：基于多序列比对与超级矩阵分析重建进化树。
- 分子进化分析：通过PartitionFinder分区方案优化系统发育模型。
- 分类群可靠性验证：利用rogue taxa分析评估分类群位置稳定性。
- 进化时间推断：基于时间校准数据集分析膜翅目关键类群分化时间。
- 系统发育方法验证：通过四簇似然映射检验分支支持度与拓扑结构可靠性。
