数据集概述
本数据集包含非模式生物靶向重测序分子反转探针（MIPs）的设计与实验数据，涉及248个MIP标记在85个样本中的应用。数据覆盖探针设计、两轮实验的VCF结果、设计脚本及参考序列，可支持非模式生物基因组区域重测序的方法评估与多态性分析。
文件详解
- 文件名称：
mips_design.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：非模式生物（如Lissotriton蝾螈）转录组设计的MIP标记信息，涉及112bp外显子区域的探针设计参数。
- 文件名称：
vcf_1st_experiment.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 字段映射介绍：第一轮MIP靶向重测序实验的VCF格式变异数据压缩包，包含85个样本的多态性检测结果。
- 文件名称：
vcf_2nd_experiment.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 字段映射介绍：第二轮MIP靶向重测序实验的VCF格式变异数据压缩包，用于验证标记性能与结果一致性。
- 文件名称：
scripts_for_MIP_design.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 字段映射介绍：MIP标记设计的脚本压缩包，包含探针设计流程的代码文件。
- 文件名称：
ref_for_248_mips.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：248个MIP标记对应的参考基因组序列文件，用于重测序比对与变异分析。
数据来源
论文“Molecular Inversion Probes for targeted resequencing in non-model organisms”
适用场景
- 非模式生物基因组靶向重测序方法研究：评估MIP技术在非模式生物中的探针特异性、覆盖均匀性与多态性检测效率。
- 分子标记开发与验证：利用VCF数据验证MIP标记的孟德尔遗传特性及基因分型一致性。
- 基因组多态性分析：通过两轮实验数据探究非模式生物目标基因组区域的遗传变异特征。
- 探针设计流程优化：基于设计脚本与参数，优化非模式生物转录组来源的MIP探针设计策略。
