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长叶双尾花的种群基因组学样本量研究数据
2026年2月10日 30 131 33
数据集概述 本数据集为亚马逊植物物种Amphirrhox longifolia种群基因组最小样本量实证研究的数据，通过ddRADseq技术获取两个隔离种群的数千个SNP标记，利用重采样模拟确定准确估算种群内、种群间遗传多样性所需的个体和标记数量，支持非模式生物进化生物学研究及种群基因组采样策略优化。 文件详解 文件名称：Pop A_ B.xlsx...
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斑点蛙属物种系统发育树_核与线粒体DNA数据分析
2026年2月9日 30 14 2
数据集概述 本数据集包含北美拟蝗蛙属（Pseudacris）物种树估计研究的相关数据，采用简化基因组文库方法开发标记，通过Illumina MiSeq平台进行平行标记扩增子测序，涉及27个核基因座和3个线粒体基因座的44个个体样本，可用于分析基因树异质性、核质基因不一致性及物种系统发育关系。 文件详解 代码文件...
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Viromes_Based非模式生物免疫蛋白预测数据
2026年1月31日 30 58 46
数据集概述 本数据集包含通过病毒组测序预测非模式生物免疫蛋白的相关数据。研究通过模拟人类病毒组与人类蛋白质组对比验证方法，再将该流程应用于造礁珊瑚（非模式生物），从珊瑚病毒组中预测出2503个珊瑚蛋白，包括病原体感知、凋亡相关蛋白及159个未注释免疫相关蛋白，为快速预测宿主免疫成分提供新方法。 文件详解 README_for_File S2-...
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ddRADseq_ion_非模式生物半导体平台测序数据
2026年1月30日 30 32 28
数据集概述 本数据集为针对非模式生物开发的双酶切RAD测序（ddRADseq-ion）实验数据，涵盖北极红点鲑、欧洲白鲑和普通蜥蜴三种脊椎动物的13个基因组文库测序结果，经Stacks工具过滤后获得多态性位点数据，包含原始测序数据、处理后的SNP数据、系统发育树文件及实验表格等20个文件。 文件详解 SNP数据文件...
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UCE_Based_超保守元件目标捕获与测序比较研究数据
2026年1月30日 30 117 54
数据集概述 本数据集为超保守元件（UCEs）目标捕获与大规模平行测序研究相关数据，包含五种新热带雨林鸟类的UCE基因座数据，涉及物种树构建、溯祖模型分析及物种界定等研究内容，共8个文件，支持浅进化时间尺度下的遗传比较分析。 文件详解 压缩文件（archive_files）...
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Lep_Anchor_Based_刺鱼参考基因组组装优化数据
2026年1月29日 30 22 12
数据集概述 本数据集记录了使用Lep-Anchor软件整合密集连锁图谱、重叠检测和长读长桥接技术，优化九刺和三刺刺鱼参考基因组组装的过程与结果。通过去除单倍型contig、提升基因组连续性（尤其是X染色体）及检测遗传变异，展示了非模式生物基因组组装优化的方法与效果。 文件详解 文件名称：NSP_V7.zip 文件格式：ZIP...
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LA4SR_Based泛微藻暗蛋白质组图谱深度学习研究补充数据
2026年1月28日 30 6 5
数据集概述 本数据集为论文“Pan-microalgal dark proteome mapping via interpretable deep learning and synthetic chimeras”的补充表格，包含LA4SR框架的性能指标、序列归因分析、关键基序发现及与传统工具的对比结果，用于支持微生物蛋白质分类研究及暗蛋白质组分析。...
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Evaluation_蜘蛛RNA保存方法对转录组组装影响评估数据
2026年1月28日 30 104 56
数据集概述 本数据集为蜘蛛RNA保存方法对从头转录组组装影响的评估研究数据，包含3个文件。研究针对野外采集蜘蛛样本，测试不同温度、防腐剂及样本浸没状态对RNA质量及转录组组装结果的影响，为非模式生物（如蜘蛛）的野外样本保存提供指导。 文件详解 文件名称：18S_all_comp.fasta 文件格式：FASTA...
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PoolParty_Based_非模式生物混池测序关联定位研究数据
2026年1月27日 30 108 46
数据集概述 本数据集围绕非模式生物混池测序（Pool-Seq）的关联定位应用展开，介绍了为降低测序成本开发的PoolParty分析流程，通过奇努克鲑鱼（Oncorhynchus tshawytscha）的案例验证其有效性，包括基因组覆盖度评估、性别相关基因定位及成熟年龄相关新基因发现，为非模式生物基因研究提供低成本高覆盖度方案。 文件详解...
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Dryad_Petrogale_岩袋鼠染色体物种形成基因组学研究数据
2026年1月26日 30 197 115
数据集概述 本数据集是澳大利亚特有有袋类动物岩袋鼠属（Petrogale）染色体物种形成研究的相关数据存档，包含与论文配套的数据和代码。内容涉及外显子捕获的系统发育结果，以及用于整合比较基因组序列数据与分子细胞遗传学证据的相关资料，旨在揭示染色体结构重组如何推动物种分化，总计包含2个文件。 文件详解 README文档...
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Pristionchus_Based_多态性开关基因复制进化研究数据
2026年1月25日 30 128 41
数据集概述 本数据集围绕Pristionchus线虫口器多态性开关基因eud-1展开，通过反向遗传学和群体遗传学分析，探究基因复制在开关基因形成中的作用，验证退化互补、中性进化及功能特化等进化场景，包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：Sulfatase_mutant_sequences.zip 文件格式：ZIP...
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Lake_Victoria_cichlid_水平条纹遗传定位研究数据
2026年1月23日 30 178 22
数据集概述 本数据集围绕维多利亚湖慈鲷水平条纹的遗传定位展开，包含通过ddRAD-seq技术构建的连锁图谱、表型数据及基因型数据。研究聚焦慈鲷水平条纹这一适应性表型，分析其遗传控制机制，同时提供RAD标记基因分型错误率的量化及质量控制指南，为非模式生物的遗传定位研究提供参考。 文件详解 Henning et al Mol Ecol...
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ABC_Inference_Based_多群体分化与基因流推断研究数据
2026年1月23日 30 161 83
数据集概述 本数据集为基于近似贝叶斯计算（ABC）的三群体分化与基因流推断研究相关文件，包含模拟脚本、分析脚本、实例数据脚本及ms命令行示例文本，用于验证ABC框架在群体基因组数据中的模型选择与参数估计效果，支持探索不同采样策略对推断质量的影响。 文件详解 模拟脚本文件： 文件名称：simulation-scripts.zip 文件格式：ZIP...
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Sex_in_the_wild_Based_自然种群有性繁殖研究补充数据
2026年1月22日 30 38 36
数据集概述 本数据集是论文“Sex in the wild: how and why field-based studies contribute to solving the problem of...
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Y_chromosome_Based_棕熊与北极熊Y染色体基因流研究数据
2026年1月22日 30 152 98
数据集概述 本数据集为棕熊与北极熊Y染色体基因流研究相关数据，基于13个新型Y染色体序列及微卫星标记，对130只棕熊和北极熊样本开展分析，还涉及390kb Y染色体支架的测序数据研究，用于揭示两者系统发育关系及雄性偏向基因流情况。 文件详解 文件名称：Submission DRYAD allele sizes.xlsx 文件格式：XLSX...
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NGS_Based_目标多重测序技术数据_线粒体与核DNA群体基因组学分析
2026年1月21日 30 153 102
数据集概述 本数据集包含目标多重下一代测序技术的相关数据，用于非模式生物的群体基因组分析，支持同时对多重样本的线粒体和核基因座进行重测序。数据覆盖跨物种DNA捕获、线粒体基因组及核基因座的富集测序方法，涉及鲸类和绿海龟等物种的基因组数据，包含27个相关文件。 文件详解 文档文件（.txt）...
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SNP_Genotyping_基于双酶切RAD测序的基因分型错误率研究数据
2026年1月21日 30 156 27
数据集概述 本数据集围绕非模式生物SNP基因分型错误率展开，通过双酶切RAD测序技术，以霍夫曼二趾树懒母子对为研究对象，分析覆盖度与序列质量对参考比对及从头组装数据集基因分型错误率的影响，同时评估错误率对亲子关系鉴定的作用，为测序方案设计提供参考。 文件详解 README_for_SNP_datasets.txt 文件格式：TXT...
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Salamanders_MHC_Based_蝾螈MHC_I基因进化原始数据
2026年1月21日 30 192 67
数据集概述 本数据集包含30种蝾螈（涵盖有尾目6科16属）的MHC-I基因外显子2和3的原始序列数据，记录了约3000种序列变体及2-22个基因拷贝/物种的结构多样性，支持分析免疫基因进化轨迹、正选择位点及重组机制，为脊椎动物MHC多样性研究提供基础数据。 文件详解 README_MHC-I_sequences_RAW_DATA.txt...
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RAD_Based_深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定研究数据
2026年1月21日 30 83 1
数据集概述 本数据集为RAD测序技术在深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定中的应用研究数据，包含12个候选物种的系统发育关系分析结果，对比了Stacks和PyRAD两种分析流程，验证线粒体标记的物种界定假设，揭示物种内遗传结构与地理分布的关联，共含2个文件。 文件详解...
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Spider_Probe_Kit_Based蜘蛛锚定杂交富集系统发育研究数据
2026年1月20日 30 203 28
数据集概述 本数据集为蜘蛛系统发育研究的锚定杂交富集（AHE）数据，包含针对蜘蛛三个分类深度的基因座和系统发育树文件：深层蜘蛛科间关系（33个类群）、捕鸟蛛科内属种关系（25个类群）及北美捕鸟蛛属种关系（83个类群）。数据集共9个文件，用于解析蜘蛛系统发育树的深层与浅层进化关系，支持分类学研究及宏观进化假说验证。 文件详解 基因座压缩文件（Loci...
