数据集概述
本数据集为南极磷虾种群基因组学研究的成果数据，包含线粒体DNA（mtDNA）与RAD-seq（限制性位点相关DNA测序）分析结果，涉及五个采样点（含两个东极地点）的磷虾样本，验证了其种群遗传结构的泛交性特征，并探讨了大基因组生物RAD-seq分析的复杂性。
文件详解
- 项目说明文档（PDF格式）：
- README_for_1 RAD-seq project info V2.pdf：RAD-seq项目基本信息说明
- README_for_2_Unique_RAD_Tags.pdf：独特RAD标签数据说明
- README_for_3a_BSP_pipeline_log.pdf：BSP分析流程日志说明
- README_for_4 Variant call format files V2.pdf：变异调用格式（VCF）文件说明
- README_for_5_VCF_extract_files.pdf：VCF提取文件说明
- README_for_6_R_code_count_PCA.pdf：R代码（计数与PCA分析）说明
- README_for_7_MtDNA_sequences.pdf：线粒体DNA序列数据说明
- 数据压缩包（ZIP格式）：
- 1 RAD-seq project info V2.zip：RAD-seq项目信息压缩包
- 2_Unique_RAD_Tags.zip：独特RAD标签数据压缩包
- 3a_BSP_pipeline_log.txt：BSP分析流程日志文本文件
- 4 Variant call format files V2.zip：VCF文件压缩包
- 5_VCF_extract_files.zip：VCF提取文件压缩包
- 6_R_code_count_PCA.zip：R代码（计数与PCA分析）压缩包
- 7_MtDNA_sequences.zip：线粒体DNA序列压缩包
- Figure 5 sequences.zip：图5相关序列压缩包
- 文本文件（TXT格式）：
- 3a_BSP_pipeline_log.txt：BSP分析流程日志原始文本
适用场景
- 南极磷虾种群遗传学研究：分析其种群遗传结构与泛交性特征
- 海洋生物基因组学研究：探讨大基因组生物RAD-seq技术应用的复杂性
- 分子生态学研究：验证南极磷虾跨地理区域的基因流与种群动态
- 生物信息学方法学研究：优化大基因组物种的RAD-seq数据分析流程
