南极毛皮海狮皮肤转录组基因发现与标记数据

数据集概述

本数据集基于12只南极毛皮海狮皮肤活检样本的标准化cDNA文库,通过454测序生成超412Mb序列数据,包含156个contigs、22869个isotigs及18576个isogroups。数据覆盖多种功能基因,多数可映射至犬类基因组,支持海洋哺乳动物基因组资源开发,用于解决鳍足类生态与进化问题。

文件详解

  • Sequence assembly.fna
  • 文件格式:FNA
  • 字段映射介绍:包含转录组从头组装的核苷酸序列数据,涵盖156个contigs和22869个isotigs的序列信息,是基因功能分析的核心基础数据
  • Microsatellite list.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:记录测序数据中检测到的数千个推定微卫星位点信息,为遗传多样性研究、种群结构分析提供分子标记资源

适用场景

  • 鳍足类基因组资源开发: 构建南极毛皮海狮转录组参考序列,支持非模式物种功能基因组学研究
  • 海洋哺乳动物进化分析: 通过基因序列比对与功能注释,探究南极毛皮海狮适应性进化机制
  • 种群遗传学研究: 利用微卫星位点数据开展种群结构、遗传多样性及亲缘关系分析
  • 非破坏性采样物种基因组学方法验证: 验证皮肤组织作为非破坏性采样物种基因表达研究材料的可行性,推广至其他珍稀物种研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 20.5 MiB
最后更新 2026年2月9日
创建于 2026年2月9日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。